Isolement et identification

[invitec74584b1]

Bonjour tout le monde
je voudrais bien connaitre la méthode à suivre pour isoler et identifier les:
-coliformes
-Pseudomonas
-E.coli
-Spores clostridium
-Staphylocoques
à partir d'une solution polymicrobienne.
Merci
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[invite853321bf]

Euh là comme ça, vu tout le monde, je partirais bien sur de la PCR

[Edelweiss68]

Euh là comme ça, vu tout le monde, je partirais bien sur de la PCR

Ça marche sur les spores de Clostridium ?

[invite853321bf]

Le protocole d'extraction de l'ADN sera plus compliqué.
De toute façon, si l'on veut identifier l'espèce, mieux vaut des PCR spécifiques de chaque espèce. Du moins c'est comme cela que je ferais.

[A voir en vidéo sur Futura]

[invite537c5180]

Bonsoir,
Il faut utiliser des milieux sélectives. Ces milieux sélectionneront des groupes bactériens bien définis et élimineront tous les autres groupes.
Exemple en utilisant le milieu Chapman

[invite537c5180]

Bonsoir;
Il faut utiliser des milieux sélectifs. Un milieu sélectif est un milieu qui permet la croissance d'un ou de plusieurs groupes bactériens bien définis et empêche la croissance de tous les autres groupes.
Exemple: le milieu Chapman est un milieu qui contient une forte concentration de Nacl donc ne laissera pousser que les bactéries halophiles tel que Staphylococcus et empêchera la croissance des autres bactéries, ce milieu "sélectionne" donc les Staphylocoques.
Sinon pour les groupes que t'as cité :
Pour les coliformes on utilise le milieu EMB (Eosine Bleu de Méthylène)
Pseudomonas: Gélose cétrimide
Sur milieu EMB on identifie E.coli gràce aux caractéristique suivantes: (colonies violettes : semi-bombées de 2 à 3mm de diamètre avec éclat métallique, centre sombre)
Les spores Clostridium: Gélose TSN.
Ce sont quelques milieux sélectifs permettant l'isolement des bactéries que t'as cité, mais il y'en a d'autres.
Ce lien te sera surement très utile:
http://www2.ac-lyon.fr/enseigne/biot...o/milieux.html
Bon courage.

[noir_ecaille]

On peut utiliser des galeries API pour les bactéries, et pour les spores je sèche un peu : bouillon à 60 °C pendant 2h, incubation anaérobie 12 à 24h puis galerie API ?

[invitec74584b1]

merci pour vos réponses.

[invite51f63da8]

salut a tous je suis entièrement d'accord avec microbiologiste20. La démarche à suivre est l'utilisation de milieux sélectifs qui grâce à certaines propriétés vont sélectionner certaines bactéries et inhiber la présence des autres. Toutes fois je ne suis pas favorable à ce que l'on utilise directement le milieu EMB par ex pour les Ecoli car je crois que certains pseudo peuvent faire de fines colonies sur ce milieu, donc je proposerais par exemple d'utiliser en plus de l'EMB un milieu intermédiaire tel que Hektoen qui va sélectionner les enterobactéries Ecoli et Pseudo puis alors une galerie Api pour chaque type de colonies.
Pour le reste c'est OK pour moi.

GideMartial