Bonjour à tous,
Je suis actuellement stagiaire dans un laboratoire de contrôle microbiologique, et mon travail consiste en l'identification et la caractérisation de nouvelles espèces dans le genre Ochrobactrum.
J'ai besoin de connaitre les principales caractéristiques phénotypiques des souches types de la quinzaine d'espèces identifiées jusqu'alors, je pense donc me baser sur les tests en API 20NE, qui me semblent une bonne référence.
Cependant, je n'ai pas la possibilité de réaliser ces tests par moi-même, je pense donc retrouver ces caractéristiques à partir des codes obtenus après tests en galeries API.
Aussi, je me suis rendu sur les différents sites de collection de culture (DSM, CCM, LMG...) et je suis finalement parvenu à trouver quelque chose d'intéressant sur le site de CCUG (Culture Collection, University of Göteborg, Sweden).
Cependant, j'ai été quelque peu surpris en voyant le code d'identification établi par la 20NE:
Phenotypic features in NFX of CCUG 48291
Tests OX 054 211321 5543 11
Tests OF 31123 121111
Tests DEC 113 111 501
Tests ESC 111 1111 5543
Tests ASSIM 4121 4212 1411 4111 33
Api API20NE 111 151 113 321 112 114 115
Api ZYM 13411 51151 41111 11111
En effet, je m'attends plutôt à trouver un code à 7 chiffres, comme on l'obtient toujours (me semble-t-il) par ce type de galerie, et non 7 triplets de chiffres comme ci dessus.
Quelqu'un saurait-il m'expliquer comment interpréter ce code, pour obtenir les 7 chiffres qui me permettront de retrouver les caractéristiques phénotypiques?
En d'autre termes, est-ce que je suis complètement à côté de la plaque ou cela vous parait-il également déroutant?
En espérant avoir été clair dans mes explications et respecté la charte du forum, je vous remercie d'avance pour toute réponse que vous pourriez m'apporter.
Cordialement
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