les gènes candidats

[invitecd580f80]

Bonjour, je suis en master de biologie et mon prof de biologie moléculaire a voulu nous expliquer une approche dont je n'ai pas compris le but . Il dit que l'on part d'une protéine possedant des domaines spécifiques et que l'on cherche l'ARNm qui code pour cette protéine pour ensuite regarder si cet ARNm est exprimé dans certaines cellules (même si ce serait plus facile de voir si la protéine s'y trouve... enfin bref). Pour retrouver l'ARNm, je comprend bien qu'à cause des oligonucléotides dégénéré il peut y avoir plus de 500 possibilité d'ARNm...
Mais, ensuite pour retrouver le bon ARN, il dit qu'on "l'hybride à haute stringence avec l'ARNm de la protéine" Alors a quoi ca sert de chercher l'ARNm si on l'a déjà!!!!! C'est peut être celui d'une autre espèce... j'ai pas compris et il n'a rien expliqué de plus...
Quelqu'un connait la méthode du gène candidat?
Merci d'avance
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[invite248f5ee3]

http://www.inra.fr/les_recherches/ex...osomes_du_mais

voir le paragraphe:


Le génome du maïs est complexe : 10 chromosomes portant environ 50 000 gènes, avec présence de duplications et de nombreuses séquences répétées (rétrotransposons). L'approche menée par les chercheurs a consisté à décrypter au moins partiellement la séquence de l'ADN de ces gènes, puis à déterminer, par des analyses bioinformatiques, les séquences qui ont une forte probabilité d'intervenir dans le caractère recherché (le programme Génoplante-maïs porte sur cinq caractères différents, voir encadré). Les chercheurs ont ainsi identifié de nombreux gènes appelés " candidats ".


d apres ce que j ai compris c est récup l ARNm
et le comparer sous logiciel de comparaison de séquence avec d autre espèces

ça se fait énormément en génétique des populations au niveau comparaison et phylogénétique de microsatellites


en plus tu peut commander dans des labo spécilisé tel ou tel séquence d ARN ADN ou autre d ou peut etre l hybridation à haute stringence mais je suis pas biologiste moléculaire

en fait c est bien beau la technique de bio mol hyper précise mais si on sait pas quelle problématique on traite ça aide pas... ils sont marrant les prof de bio mol mais faudrait qu il prennent un peu de recul pour nous expliquer...

genre listes des facteurs de transciption toujours exhaustives mais modifiées tous les ans...

[invitecd580f80]

Ca n'a donc rien a voir avec le passage d'une sequence protéique à une séquence nucléique, c'est juste pour chercher quel gene correspond à une fonction...

Ben merci beaucoup, je croi que je cherche trop à comprendre le raisonnement du prof.... de quoi devenir folle!!!
merci encore et bonnes fêtes

[invitea73d9b34]

Ce que je comprends pas c quand tu dis qu'on a déjà l'ARN. Justement on essaie de voir s'il est présent, non?

[A voir en vidéo sur Futura]