Souche et mutation

[laurent1974]

bonjour,

j'aurai besoin d'une précision, je n'arrive pas à saisir à partir de quel moment on parle de souches différentes par rapport à une mutation d'un virus.
(ça ne concerne pas spécifiquement l'épidémie actuel, mais tous les virus)
j'ai vu qu'on parlait de 2 souches jusqu'à récemment et maintenant de 3 pour le covid-19, mais on voit sur le site: https://nextstrain.org/ncov/global
que le virus évolue en permanence.

qu'est-ce qui différencie donc l’appellation "souche" et "mutation" ?

merci d'avance.
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[invite6f9dc52a]

qu'est-ce qui différencie donc l’appellation "souche" et "mutation" ?

La mutation conduit à une souche différente mais des mutations qui qui mènent pourtant à des virus différents, si ces différences sont sont suffisamment faibles ne sont pas des souches différentes à proprement parler.
Voir aussi la séquence consensus:

https://www.virologie-uclouvain.be/f...tion-genetique

https://oatao.univ-toulouse.fr/15544/1/Cadieu_15544.pdf

[laurent1974]

merci bien,
dans le 2° lien quand il est fait référence à : "quasi-espèce", il est question de "souche" (rapport à mon interrogation) ?
ou est-ce différent ?

ps: je l'ai lu en diagonal (le pdf), beaucoup de passages sont trop avancé pour mes connaissances actuelles.

[invite6f9dc52a]

merci bien,
dans le 2° lien quand il est fait référence à : "quasi-espèce", il est question de "souche" (rapport à mon interrogation) ?
ou est-ce différent ?

C'est bien la réponse. La question est simple mais la réponse ne l'est pas !!



Je vais essayer de transférer cette partie de fil en biologie...

[A voir en vidéo sur Futura]