Questions de biologie et de génétique moléculaires

[nic1305]

Bonjour a tous,
je suis nouveau sur ce forum car c'est la premiere fois que je recherche des questions de ce type, si vous connaissez un forum plus spécialisé dans mes questions, merci de me l'indiquer.

Voici mes questions :
C'est par rapport a un cours de biogen moleculaire :

- Pourquoi le nombre d'EST "expressed sequences tags" est-il très supérieur au nombre de gènes du génome humain ?

- Pourquoi le nombre d'EST correspondant à l'extrémité 3' des gènes est-il supérieur au nombre d'EST correspondant à l'extremité 5' des gènes ?

- Les STS "sequences tagged sites" peuvent-ils être le siège de polymorphisme ?

- J'aimerais aussi savoir ce qu'est et quels sont les avantages et les inconvénients de la méthode indirecte de diagnostic des maladies héréditaires par les techniques de génétique moléculaire.

- Et enfin quelle est la fréquence de recombinaison entre deux locus distants de 60 centimorgans.

Merci beaucoup a l'avance
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[Yoyo]

Bonjour,

- Pourquoi le nombre d'EST "expressed sequences tags" est-il très supérieur au nombre de gènes du génome humain ?

Cela viens de la facon de faire les banques d'EST a partir des cDNA. On peu tres bien avoir des tags a differents endroits de l'ARNm. Donc plusieurs EST pour un meme gene.

- Pourquoi le nombre d'EST correspondant à l'extrémité 3' des gènes est-il supérieur au nombre d'EST correspondant à l'extremité 5' des gènes ?

CAr lefficacité de reverse transcription (passage ARNm -> ADNc) decroit avec la distance. Comme cette reaction est initiée en 3' des ARNm, il est "logique" d'obtenir plus de sequences situées en 3' qu'en 5'. (en gros la reverse transcriptase se decroche de l'ARNm matrice au cour sde la revers-transcription, se qui cree des fragments abortifs de plus petite taille ne correspondant pas a la taille naturelle de l'ARNm

- Les STS "sequences tagged sites" peuvent-ils être le siège de polymorphisme ?

Je ne vois pas pourquoi ca ne serait pas le cas, mais ces sites ne sont surement pas dans des regions hypervariables, docn le polymorphisme doit etre faible.

- J'aimerais aussi savoir ce qu'est et quels sont les avantages et les inconvénients de la méthode indirecte de diagnostic des maladies héréditaires par les techniques de génétique moléculaire.

tu peux preciser?

- Et enfin quelle est la fréquence de recombinaison entre deux locus distants de 60 centimorgans.

Merci beaucoup a l'avance

Quand la distance est >a 50 cM il y a independance genetique. Donc la distance de 60 est un contre sens, elle n'existe pas. L'independace genetique signifie que soit les deux locus sont sur des chomosomes differents, soit ils sont sur le meme mais tellement eloignes qu'il y a toujours un crossing-over entre les deux.

Yoyo

[invited0379e4d]

Salut,
Moi je ne vais pas pouvoir beaucoup t'aider.. mais bon.
Pour calculer la frequence de recombinaison j'ai 2 formules :
d (distance entre 2 genes) = 100 x Fr
(Fr = frequence de recombinaison)

et Fr = (nbre de gamètes recombinées)/ (nbre totales de gamètes (=parentaux + recombiné))

Voilà j'espère que ça pourra t'éclairer un peu..