délai de temps entre la transcription et la traduction

[sarra672]

Bonjour,

est-ce que vous connaissez le délai qui existe entre la transcription et la traduction?

en termes d'ARN, j'observe une augmentation d'expression de mon gène cible de manière significative aprés 3 heures de traitement. à quelle moment environ verrais-je une augmentation au niveau protéique?

vous avez une idée?

merci pour vos suggestions!

[jmbowie]

Bonjour,

est-ce que vous connaissez le délai qui existe entre la transcription et la traduction?

en termes d'ARN, j'observe une augmentation d'expression de mon gène cible de manière significative aprés 3 heures de traitement. à quelle moment environ verrais-je une augmentation au niveau protéique?

vous avez une idée?

merci pour vos suggestions!

S'agit-il d'un contexte eucaryotes ou procaryotes? Dans les 2 cas, quelle est donc la souche/le genre/le tissu d'intérêt?

[sarra672]

il s'agit d'une lignée de cellules cancéreuses mammaires (MCF7)!

[Tiscarab]

salut,
ça dépend de ton gène, il y a des régulations différentes,mais je regarderais dès 6h et à 12h, le mieux est de faire une cinétique pour pas te louper (3h, 6h, 12h, 24h)!

[Yoyo]

salut

comme le dis Tiscarab il y a parfois des regulation traductionnelle qui peuvent empecher la surexpression de ta protéine.
Le seul moyen est en effet de faire une gamme, mais intuitivement j'aurai tendance a penser que tout cela se passe tres rapide et qu'en 30mn tu devrais deja voir une augmentation.

YOyo

[Squalor]

Le seul moyen est en effet de faire une gamme, mais intuitivement j'aurai tendance a penser que tout cela se passe tres rapide et qu'en 30mn tu devrais deja voir une augmentation.
YOyo

Exactement le genre de truc que j'allais mettre...

A ceci près que je dirais également que ca dépend d'un nombre énorme de facteurs environnementaux, etc...

Exemple: si tes cellules pour une raison x ont activé la réponse UPR, il pourrait y avoir des inhibiteurs de traductions génraux tel Efl2 alpha...
qui peuvent ralentir fortement ta traduction ( dans la plus part des cas)

je connais pas bien la régulation de Elf2 alpha, mais il y surement d'autres sources activation!


voila voilou...

Amicalement,

Greg

[sarra672]

merci pour vos suggestions!

ce que j'ai constaté après mon WB c'est que l'augmentation d'expression de la protéine cible se fait à 14 h!! légèrement à 6h (trés léger) et plus rien à 24h!


il me reste maintenant à faire une cinétique beaucoup plus précise pour déterminer à quel moment entre 6 heures et 14 heures on détecte ce pic d'expression.

vous êtes d'accord?

[sarra672]

merci à tous pour vos suggestions!