Le code génétique n'est pas redondant

[portugalandco]

Slt c'est une question très importante mon prof de biologie cellulaire nous a dit que le code génétique n'étant pas redondant mais dégénéré alors que depuis le lycée on nous répète que le code génétique est redondant donc j'aimerais savoir pourquoi le code génétique n'est pas redondant !!! merci d'avance

[_Mayou_]

Hmmm à la fac on nous a toujours dit que redondant et dégénéré étaient synonymes.. donc je ne me suis jamais trop posé la question !

[portugalandco]

merci quand meme mayou

[MaliciaR]

Salut,

Je crois voir ce qu'il a voulu dire. On nous a aussi dit que le code était dégénéré/redondant en parlant du fait qu'un acide aminé peut être codé par plusieurs codons. Mais on nous a dit aussi que le code n'est pas ambigu : à un codon correspond un acide aminé.

Espérant que cela aide,

[portugalandco]

Salut,

Je crois voir ce qu'il a voulu dire. On nous a aussi dit que le code était dégénéré/redondant en parlant du fait qu'un acide aminé peut être codé par plusieurs codons. Mais on nous a dit aussi que le code n'est pas ambigu : à un codon correspond un acide aminé.

Espérant que cela aide,

Pas trop mais merci quand même de m'aider; tu dis que le code génétique n'est pas redondant mais d'après mon prof il ne les pas mais merci quand même !!!!

[MaliciaR]

Euh, on est plusieurs à te dire que cette affirmation est un peu spéciale; ce serait mieux que tu vérifies tes notes... ou que tu poses la question à ton prof directement.

[Cendres]

Ca revient au même...
"Redondant" parce que plusieurs codons peuvent aboutir au même acide aminé (il y a donc redondance)...
"Dégénéré" par rapport à un code fictif où un codon donnerait un acide aminé différent à chaque fois...

Personnellement, j'ai eu les deux termes employés de façon équivalente...la signification est identique.

[portugalandco]

Euh, on est plusieurs à te dire que cette affirmation est un peu spéciale; ce serait mieux que tu vérifies tes notes... ou que tu poses la question à ton prof directement.

J'ai été voir le prof et il ma dit la même chose que le code génétique est dégénéré mais non redondant donc je comprend pas c'est pour ca que je me pose la question mais merci quand même de m'aider

[piwi]

C'est vrai que dans le cadre du code génétique on dit souvent que les termes redondants et dégénérés sont synonymes.
A mon avis, si on y réfléchit un peu, on peut se rendre compte que si les deux termes se chevauchent, ils ne recouvrent pas exactement la même chose.

La redondance a déjà été évoqué plusieurs fois dans cette discussion: il signifie que plusieurs codons peuvent coder pour le même acide aminé. Le terme recouvre une propriété générale du code génétique sans aucune interprétation fonctionnelle possible.

Pour la dégénérescence je pense qu'il faut le rapprocher du wooble pairing. On trouve ici une notion fonctionnelle. Dire que le code génétique est dégénéré c'est qu'il possède une souplesse sur la troisième base du codon et qu'une variabilité y est acceptable. C'est cette dégénérescence qui permet la redondance.

Pour ce qui est de la réflexion de votre professeur j'aimerais bien pouvoir être un peu modéré mais non, il faut le dire, c'est une ânerie!
Le code est redondant, on le constate et il n'y a rien contester là dedans qu'est ce que vous voulez faire? Après on peut discuter le terme dégénéré qui je crois est rarement compris comme je viens de le préciser.
M'enfin reste, que j'ai un peu peur que l'on demande trop de choses aux professeurs de biologie et que dans cette masse certains se perdent ce qui explique que parfois on entende ou que l'on lise des choses peut être un peu mal digérées.

Voilà pour mon petit avis du soir

Cordialement,
piwi

[portugalandco]

Ta réponse ma perturbé piwi alors j'ai pris mon téléphone et j'ai appelé un amis qui m'a dit ca et ce serait ce que le prof aurait dit en cours:
Le code génétique n'est pas redondant.
Lorsque on va lire, on va lire par triplet. Donc on lit codon triplet par triplet. Donc la 2ème ou la 3ème lettre ne sert pas au triplet suivant comme première lettre.
Donc ce code est un code à 3 lettres appelé codon triplet et en face de ce codon triplet on a l'anti-codon triplet.

Mais la dedans je vois pas trop la notion de redodance !!!

[piwi]

Arf. Ca n'a rien à voir avec la redondance cela.
Ce que vous décrivez ici c'est que le code génétique n'est pas chevauchant qui est une autre propriété du code génétique.

Reste une chose à savoir, est ce que votre professeur a parlé de redondance ou de chevauchement?

[portugalandco]

sur c'est de redondance je suis allé le voir parceque cela me paraissé bizare ; depuis le lycée on apprend que le code génétique est redondant et il me la ré-affirmé !!! donc comme c'est pour un concours cela me perturbe !!!

[sed s/war/peace/ *]

Bonsoir,

J'y vais de ma petite hypothèse, pour tenter de sauver l'honneur du monsieur.
On peut dire qu'il existe une redondance dans le code génétique
Il n'y a pas de solution optimale au codage avec un alphabet de 4 lettres {ATGC} d'un "mot" (proteine) écrit avec un alphabet de 20 lettres (les acides aminés). C'est le problème du dictionnaire.
Avec des mots de 2 nucléotides, on peut former 16 combinaisons. Pas assez...
Avec des mots de 3 nucléotides - les fameux codons, la solution retenue - on a 64 combinaisons. Beaucoup trop. Une fois qu'on a codé les stop, il reste pas mal de combinaisons. Plusieurs "codons" pour un même acide aminé, c'est pratique car cela rend les séquences codantes plus robustes (mutations tolérées sur la troisième base du codons).
Donc il y a des codons "synonymes". Donc il y a une redondance du code génétique.

Toutefois (et c'est peut-être ce que voulais dire le monsieur) il ne s'agit pas à mon avis d'une redondance au sens strict car l'utilisation d'un codon ou d'un des ses synonymes n'est pas anodine. L'efficacité de la traduction est modulé par l'usage des codons, ce qui fait que les gènes fortement exprimés utilisent préférentiellement certains codons (plutôt que d'autres synonymes) dans leurs séquences.
(pour des détails, essayez le mot-clé CAI = pour codon adaptation index. )

Hope this help (ou esperant que çà aide, plutôt....)

E.

[Yoyo]

salut

en effet 100% d'accord avec Piwi! qui donne une explication tres claire des termes. A mon avis c'est vous qui avez mélangé plusieurs concepts... chevauchant, redondant, dégénéré... pas toujours simple de tout comprendre.
Yoyo

EDit: sinon c'est vraiment le prof qui raconte n'importe quoi, la aussi je rejoins Piwi.

[MaliciaR]

[...]

Toutefois (et c'est peut-être ce que voulais dire le monsieur) il ne s'agit pas à mon avis d'une redondance au sens strict car l'utilisation d'un codon ou d'un des ses synonymes n'est pas anodine. L'efficacité de la traduction est modulé par l'usage des codons, ce qui fait que les gènes fortement exprimés utilisent préférentiellement certains codons (plutôt que d'autres synonymes) dans leurs séquences.
(pour des détails, essayez le mot-clé CAI = pour codon adaptation index. )

Hope this help (ou esperant que çà aide, plutôt....)

E.

Une question : est-ce qu'on peut mélanger le biais de l'utilisation du codon et la dégénérescence du code?

Cordialement,

P.S. Par ailleurs, ce que tu dis, Piwi, concernant le wooble, est une chose importante : je viens de revoir mes vieux cours et on nous en a parlé comme une chose distincte. Super remarque (comme d'hab, quoi )