Analyse Région intergénique

[invite4ff72fd5]

Salut .

Encore un topic sur l'annalyse fonctionnelle de génome.

J'aurai voulu savoir quelle(s) information(s) peut-on tirer de l'analyse de région intergéniques communes entre plusieurs espéces ( ici mycoplasmes ).

Dans mon cas précis, régions intergéniques autour du gène DnaA codant pour une protéine initiatrice de réplication chromosomique.

Une séquence consensus identique est détectée par MEME/MAST entre plusieurs especes de mycoplasme.

Mon idée est que l'analyse de ces séquences montre une conservation de séquence au cour de l'évolution car le gène DnaA est fondamental pour la réplication et est donc conservé.

Merci

Cordialement
Paul
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[invitec9f0f895]

Salut

j'aurai tendance a penser que si tu trouves une region conservée dans les regions intergenique tu as identifié un site important. Apres tu peux avoir, une region importante pour la regulation du gène (enhancer, silencer), ou des une region qui coderait un ARN non codant voir une proteine encore inconnue.

Yoyo

[invitec4829296]

Il n'y a aucune ORF dans ces régions conservées ?

Il a-t-il des similitudes avec d'autres organismes que les mycoplasmes ?

Annaïck.

[invite4ff72fd5]

Il n'y a aucune ORF dans ces régions conservées ?

Il a-t-il des similitudes avec d'autres organismes que les mycoplasmes ?

Annaïck.

Non aucune ORF.
On a pas comparé avec autre que mycoplasmes.

Apparement dans mon cas, il s'agirait d'une séquence de fixation de la protéine dnaA qui régule sa propre expression .

[A voir en vidéo sur Futura]