Bonjour à tous!
j'ai une question des annales
quel est le nombre de molécules de GTP qui seront utilisées pour le ribosome bactérien pour la synthèse d'une molécule du peptide codé par cet ARNm?
en fait, je ne sais pas exactement comment reposer,
comme il y a un échange entre GTP et GDP au long du cycle,
et en même temps si je compte tous les GTP pour les différents cycles;
je voudrais bien avoir vos avis
cordialement
Bonsoir,
Voici le bilan de la consommation d'énergie lors de la biosynthèse d'une protéine à X résidus chez les procaryotes:
- Aminoacylation ARNt: X ATP
- Initiation (IF2): 1 GTP
- Élongation (EF-Tu): X-1 GTP
- Translocation (EF-G): X-1 GTP
- Terminaison : 1 GTP
Ça devrait pouvoir t'aider!
Salut
Il me semble qu'il y a quelques erreur dans la liste.
il faut 2 a 3 GTP pour l'elongation (les mecanismes de proofreading consomment du GTP).
donc 3 a 4 equivalent ATP pour chaque acide aminé incorporé (en comptant l'aminoacylation).
Yoyo
J'ai un doute sur la terminaison, en effet on a bien un GTP utilisé pour changer la confo de RF3 et permettre son relarguage... mais ensuite, il faut encore dissocié le complexe 70S-ARNm-ARNt et ce grâce à RRF et EF-G, ce dernier, si je ne m'abuse utiliserai également un GTP pour donner un "dernier coup de pied" au ribosome et le séparer du messager.... Ca fait donc logiquement 2 GTP et pas un seul.
Si quelqu'un peut confirmer?
Voir : Trends in Biochemical
Sciences
Volume 28, Issue 2, February
2003, Pages 99-105
Citation "Figure:Current model of terminationandribosome recyclingin Escherichiacoli. Release factor(RF) 1 (or RF2)
promotespeptide-chaincleavageand, thus, release frompeptidyl-tRNAin theP-siteof theribosome. Release factor
RF3 catalyzesthedissociation ofRF1 (or RF2) fromtheA-site. In vivoRF3 isstablyboundto GDP, andribosomes in
complexwithRF1 (or RF2) act as guanine nucleotideexchangefactors, suchthat hydrolysisof peptidyl-tRNAenables
GTP bindingto RF3 on theribosome. This induces an RF3 conformation withhighaffinityfor theribosome andleadsto
rapiddissociation of RF1 (or RF2). Subsequently, RF3 isdissociatedfromtheribosome by a processthat requires
GTP hydrolysis. Ribosomal recycling factor(RRF) and elongation factorEF-G then bind to the70S post-termination
complexand, in a GTP-dependent reaction, inducethedissociation of thepost-terminationcomplex. Two models are
proposedfor thisstep: eitherthepost-termination complexisdisassembledintoa free70S ribosome, a deacylated
tRNAandthemRNAtranscript (blue), or intoa free50S subunit, themRNAcomplexedwiththe30S subunit and a
deacylatedtRNA, followedby thefinal displacement by initiation factorIF3 (red). "
