Interactions protéines

[invite3014d637]

Bonjour,

J'ai pu mettre en évidence (en culture cellulaire) que 2 protéines transmembranaires semblaient intéragir... Maintenant, je voudrais voir quels domaines de ces protéines pourraient intervenir dans cette intéraction... Le problème, c'est que j'y connais rien !!!
Donc j'aimerais savoir si vous connaissez un site qui répertorie tous les domaines responsable d'intéraction entre protéines... ou même mieux... s'il y avait un site qui pourrait me chercher tout ca dans mes protéines ca m'arrangerait bien...

Merci d'avance

Dowampy
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[invite02cefc91]

Bonjour !


Comment tu as mis en évidence cette intéraction ?

[invite3014d637]

Bonjour !


Comment tu as mis en évidence cette intéraction ?

J'étais sûre que la discussion allait s'orienter sur ça... plutot que sur ce qui m'intéresse...
Enfin bon...
En fait j'ai utilisé des cellules en suspension. J'ai fais des lignées stable exprimant mes protéines...(chacune d'elles sont taguée GFP ou DS-Red)
Et après je les mélange... Si ca forme des agrégats, c'est que les protéines intéragissent... Sinon, y'a peu de chance. Evidemment, cela est à verifier (double hybride ou autre)
Mais là j'ai vraiment besoin d'aide pour l'analyse de mes prot SVP

[invite02cefc91]

Pour des protéines transmembranaires, il faut faire des variantes du double hydride, la technique classique de double hydride ne fonctionne pas.

Après pour ton pb, j'avoue que je ne sais pas si cela existe

[A voir en vidéo sur Futura]

[invite3014d637]

Pour des protéines transmembranaires, il faut faire des variantes du double hydride, la technique classique de double hydride ne fonctionne pas.

Après pour ton pb, j'avoue que je ne sais pas si cela existe

Quels types de variantes?

[invite02cefc91]

Ben avec un double hybrid classique, l'interaction se passe dans le noyau mais pour des protéines transmembranaires c'est impossible donc une variane a été développé ou l'interaction se déroule hors du noyau ca s'appelle : le Yeast Split-Ubiquitin Membrane Protein Two Hybrid.

Tu utilises l'ubiquitination pour liberer s'il y a interaction un facteur de transcription qui va migrer jusqu'au noyau.

[invitea0443c8c]

Oui ou tout simplement tu fais une IP.....
Et le fait que tu vois des agrégats ne veut pas forcément dire que tu as interaction, il peut-y avoir des partenaires intermédiaires...
En ce qui concerne les domaines, tout dépend de la protéine....

V.