Banque de SNP

[invite75509155]

Bonjour à tous,

je recherche des banques de SNP complètes et facile à utiliser. Ceux qui en connaissent j'attends vos réponses et des explications si vous pouvez. Merci d'avance.
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[invite72953e70]

Bonjour,

Bonjour à tous,

je recherche des banques de SNP complètes et facile à utiliser.

Auncune banque de SNP n'est complète, dans le sens où nous ne disposons pas d'une information exhaustive sur l'ensemble des polymorphismes existants dans une population/espèce.
Facile à utiliser, ça va dépendre de votre niveau de familiarité avec les bases de données.
dbSNP, hébergée par le NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP/) , va vous permettre de retrouver beaucoup, beaucoup d'information.
Mais vous allez devoir passer du temps à consulter les fichiers README pour comprendre la structure des données.
Extraire l'information qui vous intéresse va requérir des compétence informatiques.

Un moyen facile d'acceder aux données de polymorphisme sans maitriser le SQL et les parseurs de fichiers :
Passer par le site d'Ensembl.
Une interface très intuitive appellée BIOMART permet de faire des requêtes très spécifiques en quelques cliks de souris
http://www.ensembl.org/biomart/martview/

Ceux qui en connaissent j'attends vos réponses et des explications si vous pouvez. Merci d'avance.

Je peux envisager de vous donner quelques explications si vous detaillez vos objectifs/attentes.

Hope this help,
Sed