Répondre à la discussion
Affichage des résultats 1 à 3 sur 3

Kalign



  1. #1
    mimosa

    Question Kalign


    ------

    Bonsoir à tous,
    Voilà mon problème, je n'utilise plus le logiciel d'alignement de séquences Kalign depuis quelques temps et je ne me souviens plus comment on fait. J'ai une dizaine de séquence sous format fasta que je voudrais aligner mais quand je les rentre dans le programme d'alignement de séquences protéiques il m'affiche ce message d'erreur :
    sh: /var/www/msa.sbc.su.se/cgi-bin/kalignvu: cannot execute binary file

    Je ne comprends pas!
    quelqu'un sait comment on utilise kalign ?
    Merci d'avance

    -----

  2. #2
    MaliciaR

    Re : Kalign

    Hello,

    Je ne connais pas Kalign en particulier, mais il doit réagir à peu près comme les autres. Vérifie que tu as bien ton signe > devant les noms de tes séquences, qu'il n'y a pas d'espaces inutiles (parfois, ce type de programmes ne les aime pas trop et te sortent un message d'erreur). Puis, si jamais tu n'y arrives pas, essaie ClustalW

    Cordialement,
    An expert is one who knows more and more about less and less.

  3. #3
    mimosa

    Re : Kalign

    merci, mais j'ai déjà éssayé tout ça et Clustalw n'est pas adapté à ce que je veux faire.
    Meci quand même!

Sur le même thème :