[Biochimie] Zwitterion
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Zwitterion



  1. #1
    invite5c3f4ec1

    Zwitterion


    ------

    bonjour,
    j ai un heptapeptide
    H2N-TYR-ALA-PHE-GLY-TYR-PRO-SER-CONH2
    comment fait on pour avoir la forme zwitterion de ce peptide?

    -----

  2. #2
    invite17a570c1

    Re : zwitterion

    Salut,

    Qu'est-ce qu'un zwitterion?
    Ecris les formes développées et tu y arriveras

    Cordialement,

  3. #3
    invite5c3f4ec1

    Re : zwitterion

    un zwitterion c est une molecule electriquement neutre.
    En dessinant l heptapeptide sous forme dévellopé,je n arrive pas a voir le zwitterion,meme en prenant chaque acide aminé isolement,je n arrive pas a comprendre ca

  4. #4
    invite17a570c1

    Re : zwitterion

    Ta définition est presque correcte

    En fait, il faut que la charge globale de ton heptapeptide soit = à 0 pour pouvoir prétendre à un zwitterion. Donc, si tu prends tes chaînes latérales et tes autres groupements chargés aus sein de l'heptapeptide, il faut que tu obtiennes à la fin une charge globale de 0.

    Cordialement,

  5. A voir en vidéo sur Futura
  6. #5
    invite5c3f4ec1

    Re : zwitterion

    merci,j obtiens pour les chargeS
    ph tyr R tyrNH2 tyrR SERCONH2 charge global

    4 + + +2
    8 + - 0
    10 - - -2

    le phi est donc (8+10)/2=9
    est ce que j ai bon?

  7. #6
    invite5c3f4ec1

    Re : zwitterion

    oula lol
    donc pour PH 4,j obtien une charge global de +2
    pour ph 8 J obtien une charge global de 0
    pour ph 10,j obtien une charge global de -2
    pour le phi=(8+10)/2=9
    ai je bon?

  8. #7
    invite98839ab8

    Re : zwitterion

    Je pense que tu conclu un peu vite.
    La première chose a faire est de savoir quels sont les groupements ionisables dans ce peptide et la valeur de leur pKa...

  9. #8
    invite5c3f4ec1

    Re : zwitterion

    ok,est ce qu on peut me confirmer si j ai bon?

  10. #9
    invite98839ab8

    Re : zwitterion

    A priori je n'ai pas été assez clair... Donc non, la valeur de pHi que tu as trouvé n'est pas la bonne...

  11. #10
    invite5c3f4ec1

    Re : zwitterion

    peut tu me dire stp ce qui va pas?pour que je comprenne ca au cas ou si ca tombe a l examen

  12. #11
    invited3f74a0a

    Re : Zwitterion

    Bonsoir,

    Prenons un exemple assez simple, l'alanine. Elle est sous forme zwitterion lorsque ces deux fonctions ionisables NH2 et COOH se compense en terme de charge. Donc, lorsque tu as NH3+ et COO-

    La fonction NH2 a un pK = 9,9
    La fonction COOH a un pK = 2,4

    Tu peux faire une échelle de pH sur laquelle tu insères les différents pK et tu dessines la molécule avec ses charges pour mieux visualiser le problème. Ensuite, tu peux calculer ton pHi (ce que tu as essayée de faire pour ton peptide). Ici c'est simple :

    pHi = (pKNH2 + pKCOOH) / 2
    pHi = (9,9 + 2,4) / 2
    pHi = 6, 15

    Pour ton peptide, tu fais exactement le même raisonnement, tu auras juste un peu plus de fonctions ionisables mais tu devrais trouver la réponse à ton problème.

    @ +

  13. #12
    invite5c3f4ec1

    Re : Zwitterion

    OK,donc je suis pas oblige de passer par la charge global
    donc si jprends les fonction ionisables et les extremites c et N terminal
    j ai un phi=8+10+10+8/2
    phi=18
    c est possible de trouver un phi de 18?

  14. #13
    invited3f74a0a

    Re : zwitterion

    Bonjour,

    Je te répondrais exactement la même chose que Wishangel...

    Citation Envoyé par wishangel Voir le message
    Je pense que tu conclu un peu vite.
    La première chose a faire est de savoir quels sont les groupements ionisables dans ce peptide et la valeur de leur pKa...
    Fait ce que Wishangel te conseil... Ensuite, dessine ton peptide (ou au moins ses fonctions ionisables) en fonction du pH, en tenant compte des différents pKa. Ainsi, Je pense que tu y verras un peu plus clair et tu pourras peut-être conclure.

  15. #14
    invite5c3f4ec1

    Re : Zwitterion

    les groupements ionisables sont=l extremite N terminale(pka=8),le groupement OH de la chaine laterale de la tyrosine(pka=10),le groupement OH de la chaine lateral de la deuxieme tyrosine(pka=10) et l extremite C terminal qui a ete aminé(pka=8) apres je suis bloqueé

  16. #15
    invite5c3f4ec1

    Re : Zwitterion

    est ce que quelqu un peut me dire ce que je dois trouver comme phi

  17. #16
    invite5c3f4ec1

    Re : Zwitterion

    les pkas que je dois prendre en compte sont tous superieur a 7,je peux donc pas obtenir une charge global egal a 0

  18. #17
    invitead282ff2

    Re : Zwitterion

    Bonjour,
    tu devrais trouver un phi aux alentours de 5,5, si tu te débrouilles correctement.

    Morphine

  19. #18
    invite5c3f4ec1

    Re : Zwitterion

    stp,est ce que tu pourrais me donner un exemple de peptide pour voir comment tu procedes car ca fais 2 semaines que je suis dessus

  20. #19
    invitead282ff2

    Re : Zwitterion

    En relisant ton peptide, je viens de me rendre compte que ta fonction Cter était un amide et non un acide carboxylique...

    Désolé, j'avais mal lu. Tu ne devrais donc pas trouver un phi de 5,5, une fonction amide n'étant pas ionisable (exemple asparagine, glutamine).
    Attention, une fonction amine et amide, ce n'est pas la même chose!

    Tu dois dans ton systême ne considérer que les fonctions phénol (i.e. Tyrosines) et la fonction amine Nterminale.

    Le mieux, c'est de se faire un tableau de signe et de voir entre quels pH se situe la forme zwiterrion.

    Ici, on a:

    Cter AMIDE = charge nulle quelque soit le pH
    Nter AMINE = de 0 à pH 8 = 1+ ; pH 8 à 14 = charge nulle
    Tyrosine phénol = charge nulle de pH 0 à 10 ; -2 au dessus de ph 10 (car il y a deux tyrosine.

    -------------------------pH 8------------------------pH 10 -----------------

    Cter--------0--------------------------0-------------------------------0
    Nter-------(+1)-----------------------0-------------------------------0
    Tyr --------0--------------------------0------------------------------(-2)

    A toi de finir:
    Entre quels zone de pH se situe ton peptide? Quels sont les pkA qui "bornent" la forme zwiterrion?

    Indice: Qu'il y ait une tyrosine, ou 10 tyrosines, c'a ne change rien ici. C'est peut etre celà qui gène ton calcul?

    Morphine

  21. #20
    invite5c3f4ec1

    Re : Zwitterion

    merci beaucoup
    le zwitterion serait entre pka=8 et pka=10
    donc le phi serait de 9

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