Homologues = 2 à 2?

[invitec38e3ca5]

Bonsoir!! Alors voila,

Excusez moi, j'ai honte moi-même de la simplicité de ma question!!
Voila, je n'ai pas très bien suivi depuis le début et du coup, forcément je ne comprends pas bien toutes les ficelles maintenant!! En effet, c'est plutôt du vocabulaire, de la nomenclature...

Je sais que des chromatides soeurs proviennent d'un même individu, sont identiques.

Je sais que des homologues sont 2 chromatides (?) qui codent pour la même chose mais qui ne sont pas identiques (donc 2 individus différents).

Hum, seulement je voulais savoir si les homologues concernaient 2 paires de 2 chromatides soeurs différentes, ou bien 1 chromatide entre les 2 chromatides que contiennent une paire de "chromatides soeurs"



(Désolé mais je pense que ma question est claire dans ma tête, c'est pour vous dire que si vous ne comprenez pas, à quel point je suis moi même perdu!! )
Merci néanmoins si vous avez la patience juste de me dire si on est homologue 1 à 1 ou 2 à 2!!

PS: j'ai souvent croisé cette notion mais arrivé au cas des chromosomes sexuels je me pose la question!! Je suis parti du principe qu'on était homologue 1 à 1 pour ma part...
-----

[invite31840caf]

Salut!
Ca faisait longtemps

Les 2 chromosomes de la même père sont dits homologues(un chromosome maternel et un chromosome paternel).

Un chromosome peut avoir 1(forme un bâton) ou 2 chromatides(forme un X) après réplication.

Des chromatides homologues sont donc soit au nombre de 2(2 chromosomes à un chromatide homologues mais non identiques) soit au nombre de 4(et dans ce cas identiques 2à2).

Courage et bosse bien!

[invite17a570c1]

Excusez moi, j'ai honte moi-même de la simplicité de ma question!!

Je ne savais pas que seulement les questions difficiles avaient le droit de cité ici

Je sais que des homologues sont 2 chromatides (?) qui codent pour la même chose mais qui ne sont pas identiques (donc 2 individus différents).

Qu'est-ce que des chromatides qui codent pour quelque chose?


Cordialement,

[invitec38e3ca5]

Bonsoir Novocaine!!

En fait les deux situations coexistent alors!! Je comprends mieux pourquoi le cours était aussi vague sur le sujet, sans jamais trancher clairement... Et sans nous présenter la situation telle qu'elle est d'ailleurs!

Merci Novocaine et oui ça faisait longtemps!!

[A voir en vidéo sur Futura]

[invitec38e3ca5]

Qu'est-ce que des chromatides qui codent pour quelque chose?

Euh, je dirais que ce sont des allèles en l'occurence, avec des locus bien précis si je me rappelle bien...!!
(J'évite de glisser sur la notion d'exons ou d'introns cette fois ci )

[invite17a570c1]

Euh, je dirais que ce sont des allèles en l'occurence, avec des locus bien précis si je me rappelle bien...!!

Donc, tu veux dire que chromatide = allèle?

(J'évite de glisser sur la notion d'exons ou d'introns cette fois ci )

Tu fais bien Les exons et introns font partie de quoi?


Cordialement,

[invitec38e3ca5]

Ah non surtout pas! les allèles sont des sous-ensembles des chromatides qui sont des constituants des chromosomes, je crois. Et les locus, c'est sous les allèles dans l'ordre hiérarchique!!

Les exons et les introns font partie du "fil l'ADN" [chromatine?] je dirais bêtement, mais ça tombe justement en plein dans la partie que j'ai du mal à cerner! Je sais qu'ils s'enchaînent, j'ai compris d'ailleurs le phénomène de l'épissage... Je sais qu'ils font partie du "fil d'ADN" qui lui même s'enroule autour d'octamères de... protéines? Ca reste encore assez flou!

[invite17a570c1]

Ah non surtout pas! les allèles sont des sous-ensembles des chromatides qui sont des constituants des chromosomes, je crois. Et les locus, c'est sous les allèles dans l'ordre hiérarchique!!

On y reviendra, je pense que la partie suivante est plus importante à comprendre si tu veux bien tout cerner

Les exons et les introns font partie du "fil l'ADN" [chromatine?] je dirais bêtement, mais ça tombe justement en plein dans la partie que j'ai du mal à cerner! Je sais qu'ils s'enchaînent, j'ai compris d'ailleurs le phénomène de l'épissage... Je sais qu'ils font partie du "fil d'ADN" qui lui même s'enroule autour d'octamères de... protéines? Ca reste encore assez flou!

Alors, on reprend. Qu'est-ce que le "fil d'ADN"?
Qu'est-ce que les histones?
Qu'est-ce que la chromatine et les chromosomes?


Cordialement,

[invitec38e3ca5]

Je n'arrive déjà pas à répondre d'emblée à tes questions, et c'est pourtant la base de ce qu'on a fait en biologie moléculaire...

Alors les histones sont les fameux octamères de protéines, et en fait les chromatines englobent aussi ces protéines dans leur structure, si j'ai bien compris? (honnêtement, ce sont les seules choses dont je peux me rappeler)


(un des schémas de mon cours)

Je pourrais également dire:

Chez les eucaryotes, l'ADN est associé à des protéines au sein d'une structure appelée chromatine. Les principales protéines de la chromatine sont les histones, des protéines très conservées et chargées positivement (basiques) qui s'associent très étroitement avec l'ADN (grâce à des charges négatives). En microscopie électronique, la chromatine donne l'image d'un chapelet de perles où des segments d'ADN nu séparent des repliements globulaires composés d'ADN et d'histones : les nucléosomes. Chaque nucléosome, d'un diamètre de 10 nm, est constitué de deux hétérodimères d'histones H2A-H2B et d'un tétramère d'histones H3-H4 autour desquels l'ADN s'enroule en faisant 1,65 tour sur une longueur totale de 146 paires de bases (Arents et al., 1991) (figure 10). Si les régions des histones qui forment le coeur globulaire de l'octamère sont responsables des interactions entre histones et ADN, les régions amino-terminales de ces histones, riches en lysine, pointent vers l'extérieur des nucléosomes et sont la cible de nombreuses modifications covalentes (voir page 30). Cet assemblage nucléoprotéique est verrouillé par les histones H1 et H5 ('linker histones') qui interagissent avec l'ADN. Deux nucléosomes sont séparés par environ 20 à 90 paires de bases. Le chapelet de nucléosomes est enroulé sur lui-même selon une hélice régulière (solénoïde) comprenant 6 nucléosomes par tour (pour une revue : van Holde et Zlatanova, 1996) (figure 11). La structure en solénoïde d'un diamètre de 30 nm est ancrée de façon transitoire sur la matrice nucléaire, formant ainsi des boucles d'ADN ayant une taille de 60 kb. Enfin, des protéines non-histone du groupe HMG (high-mobility group) ou SIR (silent information regulator) participent à un empaquetage encore plus complexe de l'ADN, allant de l'euchromatine, où des régions activement transcrites sont décondensées, à l'hétérochromatine, la structure la plus dense qui caractérise les régions silencieuses du génome.

( http://eprints-scd-ulp.u-strasbg.fr:...hese_body.html )
Mais bon, ce n'est pas très honnête de réarranger cela et de le poster sur le forum!!

[invite17a570c1]

Non, mais je ne te demande pas de me sortir un copier-coller d'un site. Je te demande de me dire ce que tu sais. Parce que vu la façon embrouillée que tu as de voir les choses, une mise au point s'impose

Donc, je veux mes réponses Avec tes mots.


Cordialement,

[invitec38e3ca5]

Et bien en gros on peut dire qu'on a dans l'échelle:
Chromosome ]> Chromatide ]> chromatine ]> qu'on distingue en "fil d'ADN" (je ne sais pas le nom qu'on attribue à ça!) ET histones.

Je crois que les histones ça sert surtout à ce qu'on puisse condenser sur quelque chose le fameux "fil d'ADN"?
Toujours est il que ces histones sont très conservés je crois. Il peut y avoir des méthylations, et autres opérations dessus, mais je ne saurais restituer avec exactitude déjà la liste des opérations possibles et surtout leur effet!

Donc les chromosomes, moi je vois que c'est les "X" géants, donc avec 2 chromatides, et puis qu'en fait en regardant de plus près on distingue des chromatines, qui sont en fait un peu comme (excuse la simplicité de la comparaison) des lignes à hautes tensions: c'est à dire une continuité de fils dans l'espace (le fameux fil d'ADN), et des poteaux, qu'on pourrait comparer aux histones (en structure seulement)

[invite31840caf]

Salut!! Hep Malicia.

Au lieu de partir du chromosome je crois que c'est plus facile de partir de la double hélice: la molécule d'ADN.

Oui les histones sont très conservés et peuvent être modifiés!

Je crois que les histones ça sert surtout à ce qu'on puisse condenser sur quelque chose le fameux "fil d'ADN"?

C'est mal dit mais oui. La molécule d'ADN s'enroule autour d'octamères d'histone environ 2 fois et forme un colier de perles. Bon maintenant, ensuite?
Qu'est ce qu'un nucléosome maintenant?

Bien à vous,

[invite17a570c1]

Hello,

Salut!! Hep Malicia.

Au lieu de partir du chromosome je crois que c'est plus facile de partir de la double hélice: la molécule d'ADN.

Oui, c'est pour cette raison que je voulais d'abord savoir ce que c'était que ce fameux "fil d'ADN"
Donc, c'est la double hélice d'ADN. Ensuite, puisque l'ADN ne se balade pas à poil dans la cellule, il y a les histones. Il existe différents niveaux de compaction (cf. la très mignone figure qu'Alegs a collé ci-dessus ).

Oui les histones sont très conservés et peuvent être modifiés!

Il faut bien distinguer les 2 choses et je crois que pour Alegs c'est un peu flou
"Les histones sont très conservées" signifie que leurs structures primaires (enchaînement d'aa) sont très ressemblantes lorsque la comparaison est faite entre plusieurs espèces éloignées (d'Eucaryotes, hein); on considère les histones H2A,H2B, H3 et H4. L'exemple le plus frappant est H3 dont la séquence ne varie due d'un aa entre le veau et l'Oursin et je crois, 4 aa entre le petit pois et le veau H1 présente une structure plus variable, je crois me souvenir que chez les globules rouges nucléés des Oiseaux il y a H5 et non pas H1. Ces structures très conservées des 4 histones suggèrent des repliements très similaires, mais je ne suis pas du tout spécialiste des histones (vu que c'est de l'Eucaryote ).
Ensuite, l'histoire de modification est encore plus intéressante. Justement à cause de leurs structures très conservées, on a longtemps pensé que les histones n'étaient que des protéines structurales (c'est par exemple ce que l'on m'avait rabaché au lycée). Mais que non, en fait ils assurent l'organisation fonctionnelle du support génétique eucaryote. Ce que Novocaine suggérait sont les modifications des histones (méthylations, acétylations, etc.) lesquelles sont regroupées sous le nom de modifications épigénétiques. Les queues N-ter des histones sont accessibles car elles pointent vers l'extérieur du nucléosome. Les acétylations et méthylations se font sur des lysines, les phosphorylations - sur des sérines et tyrosines. On parle de code histone. (J'ai parlé ici des Mammifères, hein ).

C'est mal dit mais oui. La molécule d'ADN s'enroule autour d'octamères
Qu'est ce qu'un nucléosome maintenant?

+1


Cordialement,

[invitec38e3ca5]

Bonjour Novocaine, bonjour MaliciaR!!

Ensuite, l'histoire de modification est encore plus intéressante. Justement à cause de leurs structures très conservées, on a longtemps pensé que les histones n'étaient que des protéines structurales (c'est par exemple ce que l'on m'avait rabaché au lycée). Mais que non, en fait ils assurent l'organisation fonctionnelle du support génétique eucaryote. Ce que Novocaine suggérait sont les modifications des histones (méthylations, acétylations, etc.) lesquelles sont regroupées sous le nom de modifications épigénétiques. Les queues N-ter des histones sont accessibles car elles pointent vers l'extérieur du nucléosome. Les acétylations et méthylations se font sur des lysines, les phosphorylations - sur des sérines et tyrosines. On parle de code histone. (J'ai parlé ici des Mammifères, hein )

Oui les histones sont très conservés et peuvent être modifiés!

Mais en fait ce sont des modifications de conformation? Par exemple vous disiez avant au lycée que c'était des protéines structurantes, c'est à dire inerte? Et maintenant vous avez découvert qu'elles assurent l'organisation fonctionnelle, mais c'est à dire quoi en fait? Le fait qu'elles peuvent changer de conformation comme un yoyo pour enrouler/dérouler l'ADN?

Qu'est ce qu'un nucléosome maintenant?

+1

Et bien j'associerai de mémoire à cette notion de nucléosome 2 expressions: "compaction" et "unité fonctionnelle".
Je me souviens d'un schéma où on représentait 3 histones, et entre, le fil d'ADN qui pendait, s'enroulait justement 2 fois comme le disait Novocaine, et continuait jusqu'à un autre. Je me rappelle qu'on a distingué 2 parties: le nucléosome qui correspond je crois à l'histone ET au fil d'ADN qui y transite, en opposition avec le fil d'ADN qui est entre 2 histones, "qui pend en l'air".

[invite17a570c1]

Mais en fait ce sont des modifications de conformation? Par exemple vous disiez avant au lycée que c'était des protéines structurantes, c'est à dire inerte? Et maintenant vous avez découvert qu'elles assurent l'organisation fonctionnelle, mais c'est à dire quoi en fait? Le fait qu'elles peuvent changer de conformation comme un yoyo pour enrouler/dérouler l'ADN?

Je croyais pourtant que j'avais fait clair
En parlant de protéines à fonctions structurale, on pense à des protéines qui n'assurent qu'une fonction : structure Autrement dit, il y a des années, on pensait que les histones ne servaient que pour entretenir une structure compactée de l'ADN que l'on appelle chromatine. Aujourd'hui, there is growing evidence, comme on dit dans plein de papiers que le rôle des histones est loin d'être limité à la simple structure. C'est pour cette raison que j'ai parlé d'organisation fonctionnelle parce que selon la position de modification et sa nature (telle lysine acéthylée par exemple) le gène sera exprimé ou pas (c'est grossier, hein ).
Sinon, le changement de conformation si aisé à tes yeux est un peu... pas très aisé en réalité...

Et bien j'associerai de mémoire à cette notion de nucléosome 2 expressions: "compaction" et "unité fonctionnelle".
Je me souviens d'un schéma où on représentait 3 histones, et entre, le fil d'ADN qui pendait, s'enroulait justement 2 fois comme le disait Novocaine, et continuait jusqu'à un autre. Je me rappelle qu'on a distingué 2 parties: le nucléosome qui correspond je crois à l'histone ET au fil d'ADN qui y transite, en opposition avec le fil d'ADN qui est entre 2 histones, "qui pend en l'air".

Juste une question : est-ce que ce point fait partie de ton programme de cette année?


Cordialement,

[invitec38e3ca5]

Euh... Oui...
En fait on a fait cette leçon en octobre, je n'étais pas encore très habitué à l'accent du prof et pis il parlait pas très fort dans le micro... De plus, il avait l'air de parler beaucoup plus à titre anecdotique que vraiment pour expliquer ses polycopiés... et pour finir, j'ai entendu beaucoup de redoublants dire qu'il suffisait de travailler les polycopiés pour tout savoir dans cette matière.
Alors j'ai fait confiance pour 2 cours auxquels je n'ai pas assisté (préférant alors me pencher sur de la biostatistique que j'avais pour janvier), et depuis fin octobre, je m'en mors les doigts! J'ai assisté à tous les cours suivants, j'ai ainsi découvert de très nombreuses choses mais il reste que les bases sont vraiment flous

Voila, et j'essaie de travailler cette matière qui me parait en fait beaucoup plus intéressante qu'il ne me le semblait au premier abord!! D'où ma présence ici
Si vous voulez vous pouvez continuer de me cuisiner, après tout ça me fait réviser, ou sinon je révise et dès que j'ai quelque chose d'obscur, je reviens!

PS: je me rappelle que j'ai trouvé un site qui "volait" le travail de nos profs, d'un élève qui avait pas réussi son concours en France et qui l'a finalement eu en Belgique, mais qui a du coup fait un site où on peut voir grossièrement ce qui se faisait il y a 5 ans (sauf en biologie moléculaire où ça n'a vraiment pas changé, il a copié collé notre polycopié et c'est toujours le même )

http://www.humans.be/bio%20cell2%20chromatine.html
En fait c'est là dessus qu'on serait interrogé à priori, en ce qui concerne la chromatine...

[invite17a570c1]

Euh... Oui...
(...)
Si vous voulez vous pouvez continuer de me cuisiner, après tout ça me fait réviser, ou sinon je révise et dès que j'ai quelque chose d'obscur, je reviens!

Je pense que c'est le mieux à faire : c'est quelque chose qui fait partie du programme de cette année, ça ne sert à rien que tu perdes ton temps pour tenter de ressortir des souvenirs flous que l'on corrige pour que finalement ça aboutisse à un gros bouillon dans ta tête

A bientôt


Cordialement,

[invitec38e3ca5]

D'accord merci pour ce qui a déjà été fait!
J'attaque de front la biologie cellulaire et je ferais des fils séparés sur des problèmes plus ciblés!

A bientôt!