Bonjour à tous,
J'ai plusieurs questions à propos du sperme de saumon utilisé pour les Northern blot :
- Pourquoi le saumon ? c'est une histoire de rendement de production d'ADN ?
- je veux faire un Northern pour détecter des transcrit provenant de cellules de poisson. Est-ce que je peux utiliser du salmon sperm DNA sachant que le transcrit en question est exprimé chez le saumon ? Y a t il une autre source d'ADN pour saturer mes membranes ?
Merci pour votre réponse.
B.
Faudrait fouiller les catalogues, mais j'ai souvenir en effet qu'il existe des variantes.
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Re: j'ai regardé dans le catalogue promega et j'ai trouvé l'ADN de Hareng (D1811 comme référence) mais à mon avis pas adapté dans ton cas.
Il y aurait l'ADN du phage lambda, mais j'ai peur qu'il ne suffise pas à saturer tes membranes.
Je viens de trouver, dans le même catalogue, de l'ADN génomique humain: G1471 et G1521 ou murin G3091. Cela devrait le faire davantage
Blast up your life!
et de l'ADNg de coli tout simplement?
YOyo
Je me disais que plus long est le génome, plus polyvalent est l'ADN. En effet, il contient davantage de séquences en statistiques et donc va saturer les sites non spécifiques de façon plus complète (notamment si tu travailles sur un génome eucaryote long). Et puis pour les Northern, j'imagine que tu peux éliminer les polyA et autres signaux absents des procaryotes.Envoyé par Yoyo
Blast up your life!
SAlut
je comprends pas les interactions non specifiques sont la plus part du temps dues a des interaction electrostatiques ou hydrophobes. La séquence de l'ADN utilisé comme bloqueur n'a aucun interet.
YOyo
Merci pour toutes ces infos. En effet, il y a bien de l'ADN génomique de souris dans catalogues. C'est parfait.
Par contre Yoyo, je suis intéressé par ce que tu dis au niveau de l'interaction entre ARN et la solution de blocage par ADN génomique. Penses-tu vraiment que ce sont des interactions non spé (i.e. indépendamment de la séquence) ?
Ben
