détails du cycle de Krebs

[inviteb9ffe72a]

1) l'acide alpha-cétoglutarique s'oxyde en succinyl-CoA en deux étapes:
-une déshydrogénation
-une décarboxylation

Comment se fait la déshydrogénation ??? un des hydrogènes à enlever par la déshydrogénase se situe sur la fonction COOH et l'autre où ? sur le CoA-SH ?

2) J'ai remarqué que certaines enzymes effectuent deux tâches, et prennent néanmoins le nom associé à une seule. Par exemple,
l'isocitrate déshydrogénase qui agit aussi (apparemment) par DECARBOXYLATION de l'oxalosuccinate obtenu après déshydrogénation de l'isocitrate..

Merci.
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[inviteb9ffe72a]

aucune réponse ?

[inviteb6144ea4]

Bonjour,

Pour simplifier les choses, oui, on peut dire qu'au final, un hydrogène "quitte" une fonction COOH de l'acide alpha cetoglutarique (la fonction en alpha pour être précis) et le deuxième "quitte" le coenzyme A effectivement.

Mais il faut savoir que dans la réalité cette réaction est beaucoup plus complexe et résumer ainsi, c'est faire quelques abus.
Il s'agit en fait d'une décarboxylation oxydative qui est sous l'influence d'un complexe enzymatique (que l'on appelle alpha-ceto-glutarate-déshydrogénase) et qui a pour coenzyme: le pyrophosphate de thiamine, le coenzyme A, le FADH et le NAD+.

Si tu veux plus de détail, sache que le mécanisme réactionnel est semblable à la décarboxylation oxydative de l'acide pyruvique en acétyl-coenzyme A. Une petite recherche sur Google avec ces mots clés et je pense que tu auras de beaux schémas qui t'aideront sans doute mieux que mes explications verbales.


Concernant l'isocitrate déshydrogénase, tu as parfaitement raison, elle catalyse deux réactions différentes:
- l'oxydation de l'isocitrate (ou déshydrogénation, comme tu veux, c'est la même chose)
- la décarboxylation de l'acide oxalo-succinique obtenu en acide alpha cetoglutarique

En espérant avoir pu t'aider

Cordialement

[invitef9da3eb4]

Salut, les amis.

Je ne suis pas d'accord avec vous pour ce qui concerne la deuxième question, car l’isocitrate déshydrogénase à NAD⁺ ne catalyse que la déshydrogénation de l'isocitrate en donnant de l'oxalosuccinate. Cet oxalosuccinate étant un composé instable va se décarboxyler spantanément en formant l'a-cétoglutarate.

Et pour la première question, c'est vrai, l‘a-cétoglutarate déshydrogénase est un complexe multi-enzymatique qui utilise les cofacteurs que Moumoutte vient de citer, seulement c'est le FAD et non le FADH qui intervient dans cette réaction, en plus il y a un autre cofacteur qui est le lipoate. Le mécanime de la réaction est semblable à celui de la pyruvate déshydrogénase.

[A voir en vidéo sur Futura]

[inviteb6144ea4]

Bonjour,

Je ne suis pas d'accord avec vous pour ce qui concerne la deuxième question, car l’isocitrate déshydrogénase à NAD⁺ ne catalyse que la déshydrogénation de l'isocitrate en donnant de l'oxalosuccinate. Cet oxalosuccinate étant un composé instable va se décarboxyler spantanément en formant l'a-cétoglutarate.

Moui, je n'étais pas rentré dans les détails enzymatiques, mais ce qui se passe réellement, c'est que l'enzyme ne libère pas le produit intermédiaire qu'est l'oxalosuccinate. A noter, c'est vrai, que l'isocitrate déshydrogénase n'a aucune affinité pour l'oxalosuccinate libre, d'où, peut être notre confusion.

c'est le FAD et non le FADH

évidemment

Cordialement

[inviteb9ffe72a]

merci à vous deux, c'était
impeccable !

apparemment, vous vous y connaissez profondément en biochimie.