bonjour, je ne comprend pas deux choses à mon cour si quelqu'un pouvait m'expliquer.
Je n'arrive pas à comprendre comment faut-il faire lorsque l'on possède une matrice de caractères pour reconstituer tout les arbres possibles,
comment savoir le nombre d'arbre possible?
Et aussi je n'arrive pas à comprendre ce que signifie qualifier les
caractère correspondants à chacune des positions de la séquence
nucléotidique de la matrice?
merci d'avance.
Bonjour,
Je répond assez tard à ton message, mais sache que la matrice dont tu parles correspond à un arbre phylogénétique parenthésé.
Les chiffres dans la matrice correspondent à une distance entre les espèces (il y a une équivalence entre le chiffre et la taille de ton trait qui sont donnés généralement).
Cette distance prend en compte non pas les traits verticaux de ton arbre mais les traits horizontaux.
exemple: ((humain: 0,43389, chimpanzé: 0,43101): 0,04639, (rat:......)), ici le chimpanzé et le rat sont sur deux branches parallèles qui se rejoignent, les chiffres après les deux points correspondent à l'équivalent de la distance du trait horizontale pour chaque espèce. Les chiffres après les points qui sont derrières une parenthèse fermée correspondent à la distance entre le (chimpanzé, l'humain) et (le rat).
En espérant avoir répondu assez clairement à votre question. ^^
