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spécificité d'une séquence adn



  1. #1
    Pr.Tournenron

    Exclamation spécificité d'une séquence adn


    ------

    Bonjour!
    je dois calculer le nombre de nucléotides que devrait avoir une séquence unique dans l'adn. J'ai une idée mais j'aurais besoin de connaître la fréquence d'une séquence considérée comme unique... qn pourrait-il m'aider? Merci

    -----

  2. #2
    piwi

    Re : spécificité d'une séquence adn

    Il vous faut connaitre la taille de la séquence que vous considérez. La probabilité de trouver une séquence, de 20 bases par exemple, est nulle sur un fragment de 15pb, non nulle si on considère une séquence de 109pb.

    Cordialement,
    piwi
    Je sers la science et c'est ma joie.... Il parait.

  3. #3
    Pr.Tournenron

    Re : spécificité d'une séquence adn

    Je n'ai peut-être pas bien compris mais, je ne vois pas comment connaître la taille de la séquence puisque c'est ce qu'on me demande... trouver la taille d'une séquence unique dans tout l'adn, le prof nous a dit qu'on devait savoir le faire, en ce qui me concerne la réponse ne me saute pas aux yeux...

  4. #4
    piwi

    Re : spécificité d'une séquence adn

    Et bien prenons un exemple d'un fragment de 6 paires de bases et considérons la distribution des nucléotide aléatoire dans notre séquence.
    La probabilité de trouver notre premier nucléotide est de 0,25. Celle ci réalisée on a 0,25 de trouver le second... Etc.
    La probabilité de trouver notre séquence est donc 0,256
    On la trouvera tous les 4096 nucléotides.

    Pour faire le reverse il faut donc considérer la taille de votre génome N, et la taille n de votre séquence.
    0,25-n=N <=> -log N/log 0,25= n
    Si on considère le génome humain de 3.109 pb on aura:
    -9,48/(-0,60)= 15,8 = 16

    Vous voyez qu'il n'y a pas de réponse absolue, il faut connaitre la taille de la séquence que vous considérez.
    Je sers la science et c'est ma joie.... Il parait.

  5. A voir en vidéo sur Futura
  6. #5
    Pr.Tournenron

    Re : spécificité d'une séquence adn

    Merci beaucoup!!! maintenant c'est clair

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