Modélisation de protéines

[haleckx]

Bonjour à tous!
Je suis à la recherche d'un logiciel (ou site web) permettant de modéliser le repliement d'une protéine selon la séquence en acide aminé. En clair, je veux voir comment se repliera une certaine séquence en 3D, afin de voir si j'obtiens des hélices, etc.

Merci à l'Avance!
-----

[MaliciaR]

Salut,
Tu as quelques informations ici : http://en.wikipedia.org/wiki/Protein...ure_prediction

[Flyingbike]

il y a plusieurs possibilités selon le niveau de détail que tu souhaites. Certains outils (dont quelques uns sont disponibles en ligne) permettent rapidement d'anticiper sur la possibilité de structures secondaires ou tertiaires (hélices feuillets, segments transmembranaires....). Pour avoir un rendu plus réaliste, il y a des outils plus complexes qui calculent l'energie de la protéine en fonction de sa conformation, permettant de déterminer la conformation la plus réaliste, mais il faut maitriser des paramètres comme la composition du milieu, etc... Ce genre de modélisation peut prendre plusieurs jours de calculs !