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Technique Microarray = puce à ADN



  1. #1
    luluchipie

    Technique Microarray = puce à ADN


    ------

    Bonjour,

    J'ai compris la technique, ce que je me demande c'est est-ce que la totalité du génome humain doit être déposé sur la puce ?
    Dans mon cours on a pris l'exemple d'une levure, son génome ne contient "que" 6000 gènes" mais pour l'homme comment fait-on ? Il doit très certainement en compter beaucoup plus. Ou est-ce que l'on dépose sur la puce uniquement les gènes susceptibles d'être surexprimés dans le cas de la pathologie considérée ?

    Merci d'avance.

    -----

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  3. #2
    Flyingbike

    Re : Technique Microarray = puce à ADN

    je ne suis pas un spécialiste, mais il existe différents types de puces. Certaines contiennent des sondes pour quelques gènes particuliers regroupés par "thème", en tout cas toutes les puces ne sont pas faites pour contenir des sondes pour tout un génome...

  4. #3
    Edelweiss68

    Re : Technique Microarray = puce à ADN

    Bonjour,

    Certaines puces utilisées dans l'hybridation génomique comparative (CGH array) couvrent tout le génome. Cependant, il y a toujours des "trous" entre 2 sondes.

  5. #4
    kamor

    Re : Technique Microarray = puce à ADN

    Citation Envoyé par luluchipie Voir le message
    Bonjour,
    Ou est-ce que l'on dépose sur la puce uniquement les gènes susceptibles d'être surexprimés dans le cas de la pathologie considérée ?
    Si on connait déjà les gène surexprimés, ça ôte un peu l'intérêt de la technique, non ?
    Comme déjà dit, une puce existe pour des organismes plus complexe, il faut juste plus de puits.
    J'ai un peu perdu le fil du nombre de gènes humain qui a pas mal été réduit. Je m'étais arrêté à 20 000 mais c'est peut être un peu moins.

  6. #5
    MaliciaR

    Re : Technique Microarray = puce à ADN

    Salut,

    Citation Envoyé par luluchipie Voir le message
    Bonjour,

    J'ai compris la technique, ce que je me demande c'est est-ce que la totalité du génome humain doit être déposé sur la puce ?
    De quels types de microarrays parles-tu ? Celles visant à détecter des différences d'expression ? Celles de reséquençage ? Les tiling arrays ? CGH ?


    Citation Envoyé par kamor Voir le message
    Comme déjà dit, une puce existe pour des organismes plus complexe, il faut juste plus de puits.
    Kof kof... On ne va pas lancer un troll sur les "unicellulaires = moins complexes que pluricellulaires" ?
    An expert is one who knows more and more about less and less.

  7. A voir en vidéo sur Futura
  8. #6
    kamor

    Re : Technique Microarray = puce à ADN

    Non MaliciaR, c'est un méchant raccourci pour dire "avec plus de gène" et je m'en excuse. Etant microbiologiste (enfin essayant de l'être ), je ne peux pas penser cela

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