Transcription ?

[invite7ade5207]

Bonjour,

Je sais que ce sujet a déjà été traité sur ce forum mais malgré les explications données je ne comprends pas mieux.

Je voudrais donc savoir comment on peut reconnaitre le brin à transcrire lors d'une transcription.

Par exemple : Voilà une séquence d'ADN procaryote double brin

5' TCGCGCGTTTCGTTGACAACGCTCCTCACC TCTGACCTCCCGGATTATAGGAGGGCTTG 3'


3' AGCGCGCAAAGCAACTGTTGCGAGGAGTGG AGACTCGAGGGCCTAATATCCTCCCGAAC 5'


Comment puis je alors savoir lequel brin je dois prendre pour la transcription ?

Merci d'avance.
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[invite71f23525]

Bonjour,

Tu ne peux pas le savoir sans plus de renseignements. Il te faut connaitre la séquence de l'ARNm transcrit à partir de cette séquence double brin pour savoir quel est le brin transcrit. Ou alors il te faut connaitre la séquence de la protéine codée, avec le code génétique tu retrouves la séquences de l'ARNm et de là le brin transcrit.

[piwi]

Sans plus d'information, tu auras du mal à le savoir dans la mesure où pour chacune des deux orientations il y a une ou plusieurs frames ouvertes.

Cordialement,
piwi

[invite7ade5207]

Merci pour vos réponses rapides.

En fait, il demandait de reconnaitre le promoteur de transcription et l'ARN résultant.
Et donc ils se sont consacrés qu'au brin (2) en 3'5'.
Et je me demande bien pourquoi ce brin.

[A voir en vidéo sur Futura]

[invite71f23525]

3'-AGCGCGCAAAGCAACTGTTGCGAGGAGTGG AGACTCGAGGGCCTAATATCCTCCCGAAC-5'

En gras : le pourquoi de la chose. C'est une boîte TATA qui permet la fixation de la TATA-binding protein, la première protéine du complexe général de transcription à se fixer sur la région proximale des promoteurs.

[invite7ade5207]

Mais dans le premier brin aussi on peut voir une boite TATA.


5' TCGCGCGTTTCGTTGACAACGCTCCTCACC TCTGACCTCCCGGATTATAGGAGGGCTTG 3'

[gorben]

3'-AGCGCGCAAAGCAACTGTTGCGAGGAGTGG AGACTCGAGGGCCTAATATCCTCCCGAAC-5'

En gras : le pourquoi de la chose. C'est une boîte TATA qui permet la fixation de la TATA-binding protein, la première protéine du complexe général de transcription à se fixer sur la région proximale des promoteurs.

Enfin comme c'est chez les procaryotes, on parle plutot de facteurs sigma

[invite7ade5207]

Personne peut me dire pourquoi le brin 2 alors que sur le brin 1 on voit aussi une boite TATA ?

[invite2f8e0e11]

Mais dans le premier brin aussi on peut voir une boite TATA.


5' TCGCGCGTTTCGTTGACAACGCTCCTCACC TCTGACCTCCCGGATTATAGGAGGGCTTG 3'

5' TCGCGCGTTTCGTTGACAACGCTCCTCACCTCTGACCTCCCGGATTATAGGAGGGCTTG 3'

sur le brin 5' -> 3' il y a également la séquence consensus -35 et même si il y a la boite de Pribnnow en -10 (qui n'a que TATA au lieu de TATAAT) la distance est peu être un peu forte entre les deux pour que ce soit un promoteur et le concencus TATAAT est moins respecté que sur l'autre brin.

je penche donc plutôt pour le brin 3' -> 5' et sont 3'TAATAT5' et l'ARNm qui commence a environ 8 - 9 pb plus loin en 3'

[piwi]

Franchement, à bien regarder les brins, je ne vois pas ce qui peut déterminer le choix per se. Une séquence TATA, c'est quand même assez facile à trouver et à elle seule ce n'est vraiment significatif.
C'est un papier? Si oui, quelle en est la référence?

Cordialement,
piwi

[invite7ade5207]

Oui, c'est un exercice qu'il m' a été donné par la fac.