formulation inconnue

[invite6a6b1a73]

Bonjour,

je ne sais pas ce que signifie cette écriture: mBD-CYCA2;3-GFP. Je sais que c'est la cycline de type A, spécifiquement la A 2;3, est fusionnée à la GFP pour la localiser. Mais que veut dire mBD?

Merci de votre aide
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[Jean-Luc P]

Ce ne serait aps le nom du vecteur qui la porte par hasard ? Ou le promoteur, m'enfin un truc du genre, lié à l'ADN recombinant.

[kamor]

Serait il possible d'avoir le contexte ? Ca peut aider

[piwi]

Le plus souvent, une petite lettre en début de nom de gène permet de définir l'espèce d'origine. m se rapporte à la souris.
BD correspond quand même assez souvent à binding domain (domaine de liaison). Même si il est vrai qu'en dehors de tout contexte, il peut signifier tout et n'importe quoi.

Donc à première vue on pourrait penser qu'il s'agit du domaine de liaison de la cycline couplé à la GFP.

Cordialement,
piwi

[A voir en vidéo sur Futura]

[Edelweiss68]

Aux vues de ça :

"A-type cyclins contain destruction box (D-box) sequences, which have been reported to mediate protein degradation (Glotzer et al., 1991). To express the CYCA2;3-GFP fusion protein at even higher levels, we changed its D-box sequence to a nonfunctional one (from RAVLGEITN to GAVVGEITN; see Figure 2B) (Genschik et al., 1998) and inducibly expressed the protein, mDB-CYCA2;3-GFP, in CYCA2;3(−/−) plants."

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1356546/

Je dirais que cela signifie "mutation de la Boîte de Destruction".

[LXR]

Je ne pense pas puisque l'ordre ne correspond pas : en français boite de destruction (BD) mais en anglais destruction box (DB). En revanche je rejoint l'idée de piwi puisque les kinases possèdent un domaine de liaison au substrat, et un domaine catalytique portant l'activité kinase. Les CDK portent l'activité kinase, les cyclines portent le domaine de liaison au substrat (binding domain), l'association des deux permet la formation d'une kinase fonctionnelle. En faisant une recherche sur un site de bioinformatique comme prodom ou autres (je ne les ai pas tous en tête, mais une recherche à partir d'Expasy devrait te donner de bonnes pistes) te permettra de connaitre les noms des différents domaines de cette cycline.