Facteur de transcription MYB80

[invite04cd6602]

Bonjour à tous,

Désolé de vous déranger, mais je vous écrit car je ne comprend pas une expérience d'un article scientifique sur le MYB80.

Afin de déterminer les gènes qu'il régule(au niveau des anthères) ils font tout d'abord une expérience de microarray(sur des mutants et WT) et il trouve 400 gènes différentiellement exprimés.

Par la suite il utilise un transformant qui exprime le MYB80 sous la dépendance de GR(glucocorticoide) qui empêche la protéine de s'introduire dans le noyau, seul le traitement au DEX permet de la faire rentrer. Sachant que ce MYB n'a un rôle que dans le noyau ils auraient du trouver le même résultat que le microarray sur le mutant, mais ce n'est pas le cas.

Pourriez-vous m'expliquer en quoi est utile cette technique, et pourquoi ils trouvent des résultats différents?
Merci d'avance,
Cordialement
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[invite02cefc91]

Bonjour,

Le transformant suexprimant MYB80 a été réalisé dans une lignée sauvage ou dans la lignée mutante. Si cela a été réalisé dans la lignée sauvage, il te reste encore le gène endogène qui peut remplir sa fonction. Es-ce le cas ?

[Flyingbike]

il y a des dizaines d'explications possibles.

Par exemple :
-timing différent
-dans la deuxième approche, on a une protéine de fusion. Peut être que ça modifie son fonctionnement
-le microarray est une approche très globale, les gènes qui bougent ne sont pas forcément des cibles directes
-traitement à la dex pour transloquer la protéine ? c'est un peu extrême, sachant tous les effets que peuvent avoir les corticoïdes (surtout celui-là)
etc...

Donc pour conclure, on ne peut pas s'attendre a avoir des résultats comparables avec des méthodes si différentes.