Utilisation de BLAST ? Mode d'emploi ?

[invite5603e306]

Bonjour à toutes et à tous =)

Je suis en train de travailler sur un projet de recherche axé sur un nouveau lipopetide : la kurstakine.
En effet, la kurstakine présente une structure originale : elle présente un résidu histidine, ce qui est rare dans le monde des bactéries.
Je pense que l'histidine peut conférer des propriétés spécifiques et exclusives chez la kurstakine.
Donc je me suis dis pourquoi ne pas faire une comparaison de séquence peptides avec toutes les autres bactéries totalement ou partiellement séquences à l'aide de BLAST ? Seulement voilà, je ne comprends pas comment fonctionne cette plateforme. Je ne dispose que de la séquence peptidique de la kurstakine

Quelqu'un pourrait-il m'eclairer s'il vous plait ?

Merci d'avance.
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[invite6db3a1dc]

Moi non plus j'ai jamais compris le fonctionnement de ce logiciel, enfin je m'y suis jamais intéressée, mais j'en ai besoin alors please help ^^

Rubisco59, ton pseudo m'intrigue, t'as une histoire avec cette enzyme ? parce que en ce moment je suis entrain de l'étudier et elle me mène pas la vie belle lol

[Flyingbike]

eh bien tu vas dans blast, tu choisis protein blast, tu rentres ta séquence dans la grande boite et tu valides. Ca va te sortir les protéines qui se rapprochent le plus de la séquence entrée.

Si tu veux spécifier ensuite les organismes auxquels se limiter, il suffit d'ajouter les taxons a la liste

[invite5603e306]

Merci beaucoup les amis, je vais de ce pas tester
@Biologiste : ah non non ? Aucune histoire, c'est juste que cette enzyme m'intrigue beaucoup et je pense que dans quelques années je me ferais un plaisir de faire une thèse sur ça

Encore merci

[A voir en vidéo sur Futura]