Epidémie de diarrhées (tp)

[laurarentia]

Bonjour, je suis en L1 biologie et j'ai des questions à propos d'un test moléculaire fait en cours sur les souches des bactéries causant la diarrhée. Nous avons vu que la plupart du temps elle est due aux gènes invasive et adhésine. Nous avons réalisé une électrophorèse des plasmides des malades, nous savons qu'il y a deux souches différentes de bactéries causant la diarrhée et notre but est de savoir si la diarrhée étudiée est causée par l'invasine et l'adhésine en comparant la tailles des fragments d ADN qui ont migré avec la carte de restriction de l'invasine et adhésine. J'ai tracé le graphe distance parcourue en fonction de la taille des fragments pour avoir une droite étalon mais je n'arriva pas à savoir s'il y a des similitude entre les fragments d'adhésine et invasine et les plaide étudiés donc à savoir si ces deux gènes sont les responsables de l'épidémie.
Si quelqu'un pouvait m'aider, c'est la 1ère fois que je fait un tp de ce genre.
Merci. IMG_0125.jpgIMG_0124.jpgIMG_0129.jpg
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[Inkald]

Il s'agit de quelle souche bactérienne ?

[laurarentia]

Des souches d'Escherichia coli

[Inkald]

E. coli étant commensales en général chez les mammifères, il est sur que ce soit l'adhésine et l'invasine (portées par un plasmide afa-3) qui soient responsables des diarrhées. Je sais qu'il existe un logarithme entre la taille des fragments en fonction de leur distance de migration... es-tu sur que ton graphe est bien axé ?

[A voir en vidéo sur Futura]

[laurarentia]

Le problème est qu'en essayant de comparer les fragments de références avec ceux de l'expérience je ne trouve pas qu'ils font la même taille de paire de base.

[Inkald]

Pas obligé que ce soit exactement la même taille, si c'est dans le même ordre de grandeur alors ça fonctionne.

[laurarentia]

D'accord merci. Si pour une souche je trouve 2 fragments du même ordre de grandeur que les fragments de référence et que pour une deuxième souche je trouve aussi deux fragments du même ordre de grandeur, je ne peux pas conclure ?

[Inkald]

Non parce-qu'il me semble qu'ont ai à faire au même plasmide de référence si au moins trois fragments expérimentaux présentent une similitude avec trois fragments de référence.

[laurarentia]

Ok, merci. Je vais essayer de retracer ma droite étalon alors.