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Structure secondaire ARN



  1. #1
    Ecrevisse

    Structure secondaire ARN

    Bonsoir,

    J'aimerais savoir si il y a une technique afin de connaitre les structures secondaire que va adopter l'ARN (tête d'épingle, bulge etc...) juste avec la séquence de nucléotides de cet ARN. J'ai repris un exemple d'une annale de mon prof, mais je ne sais pas comment trouver la bonne réponse.

    Merci bien =)

    -----

    Images attachées Images attachées

  2. #2
    Flyingbike

    Re : Structure secondaire ARN

    il faut essayer de voir si l'ARN peut se plier et être au moins en partie auto complémentaire. Normalement on ne fait pas ça a la main...
    La vie trouve toujours un chemin

  3. #3
    Ecrevisse

    Re : Structure secondaire ARN

    Du coup au niveau des extrémité on peut faire une double hélice sur 3 nucléotides (peut être 4 si on forme une liaison G-U), mais après pour le reste y'a 2-3 paires qui s'apparient, le reste non. Mais ça fait quand même 17 nucléotides seules. Du coup je sais pas trop quoi faire avec ces dernières nucléotides

  4. #4
    Flyingbike

    Re : Structure secondaire ARN

    on peut s'amuser avec des logiciels de prédiction de structure secondaire, qui eux testent les conformations les plus stables

    Bien sur il y a beaucoup de paramètres qui influent (température, concentration en sels, en ARN, etc...) mais on peut obtenir ce genre de truc avec les paramètres par défaut :

    Fold.jpg
    La vie trouve toujours un chemin

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