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Comment génotyper des mutants de sorgho



  1. #1
    nikephil65469

    Comment génotyper des mutants de sorgho

    Bonjour tout le monde, j'ai un souci que je voudrais soumettre à votre appréciation. En effet, nous avons irradié des semences de sorgho au rayons gamma et nous avons développé des populations de mutants. Maintenant, nous voulons savoir si l'irradiation a créé une mutation (c'est à dire une diversité génétique par rapport au témoins non irradiés) dans les lignées développées. Mais nous ne savons pas quels types de marqueurs sont adaptés à l'étude de la diversité génétique des mutants. C'est pourquoi j'aimerais savoir si quelqu'un pourrait me guider à cet effet. j'ai fait de la recherche sur internet mais la bibliographie sur le sujet est très pauvre et je n'ai pu avoir de documents.
    Merci d'avance

    -----


  2. Publicité
  3. #2
    Flyingbike

    Re : Comment génotyper des mutants de sorgho

    Séquençage?
    La vie trouve toujours un chemin

  4. #3
    nikephil65469

    Re : Comment génotyper des mutants de sorgho

    Bonjour, voulez vous me dire que la seule issue est le séquençage? En faite, j'ai cru qu'on pouvait génotyper des mutants avec des marqueurs SSRs (microsatellites) ou autres marqueurs, c'est pourquoi je cherche des précisions.
    cordialement

  5. #4
    Flyingbike

    Re : Comment génotyper des mutants de sorgho

    Mais si ce sont des mutations ponctuelles dans une séquence codante par exemple ?
    Vous attendez quel type de mutation ?

    On peut génotyper des mutants ainsi quand ils sont déjà caractérisés, mais des mutations ou réarrangements de novo, comment vous feriez ?

    (Je ne suis pas un spécialiste mais j'espère avoir compris votre problématique)
    La vie trouve toujours un chemin

  6. #5
    nikephil65469

    Re : Comment génotyper des mutants de sorgho

    Merci pour vos réponses même si vous n'êtes pas spécialiste. En effet, le type de mutation n'est pas déterminé. Les semences ont été irradiées à différentes doses donc on peut avoir plusieurs types de mutation: délétion, substitution ou insertion, c'est-à-dire que c'est vraiment aléatoire. En faite, l'objectif de ce travail est de voir si la mutation permettra d'avoir des gènes d'intérêts exploitables pour des caractères d'intérêt comme la résistance au striga hermonthica, à la sécheresse, etc. Et si l'on trouve des mutants qui présentent ces caractères, comment montrer qu'ils sont moléculairement différents des témoins. Voici en résumé le problème. sinon on peut faire un criblage pour identifier les lignées qui ont les caractères que nous voulons mais on a du mal à lier ces changements à la mutation sur le plan moléculaire.

  7. A voir en vidéo sur Futura

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