Salut à tous!
Dans le cadre d'un exercice important, je dois trouver des informations sur une page PDB notamment.
Après avoir tapé 2HYY (code de Human Abl kinase domain in complex with imatinib (STI571, Glivec) sur la page d'entrée, il y a cette question :
La structure de la protéine a-t-elle été obtenue pour l’ensemble de la séquence ou pour un domaine particulier de la protéine ?
https://www.rcsb.org/structure/2HYY
J'ai lu l'abstract qui m'a semblé clair. Mais dans la partie "Macromolecules", il y a une représentation dont j'ai du mal à saisir toutes les significations. Quelqu'un pourrait il m'aider car j'ai compris que je trouverai la réponse à cette question dans ce graphique. De même, pour la partie Small Molecules, quelles infos sont disponibles? Je vois bien que c'est le ligand (imatinib = inhibiteur mais pour le reste...)
Si quelqu'un maitrise la PDB ce serait parfait pour m'expliquer les différentes caractéristiques de ces 2 sections (macromolecules et small molecules)!
De plus on lit : "Proto-oncogene tyrosine-protein kinase ABL1"
A t'on à faire à 1 gène ou à l'enzyme...?! C'est encore un peu flou pour moi.
Ensuite on me pose 1 question sur l'imatinib. Je répond que c'est l'inhibiteur...etc
Enfin, il est demandé de cliquer en haut sur "3D View". On ouvre un fichier NGL et dans les options en sélectionnant assembly unit ou quelque chose du genre puis color by chain on remarque 4 chaines et on me demande si il s'agit de la même protéine pour les 4. Je réponds oui.
Donc si vous pouviez confirmez ou infirmez mes réponses et me donnez plus amples explications sur les points qui me posent problème, je vous remercie beaucoup!
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