Excel - recherche fonction

[Great.J]

Bonjour,

Voici mon problème
Je cherche à créer une séquence consensus à partir de séquences ADN sue excel.

Pour faire simple (et pour ce qui ne connaissent rien à la biologie):
Dans la ligne 1 figure des lettres (A, T, G ou C), entre 500 et 5 000 lettres, de façon à ce que chacune d'elles soit dans une cellule différente
A1=A; A2=T; A3=G etc.
Les autres lignes sont composés de la même façon.
Je voudra arriver à mettre une fonction, si c'est possible, qui permet de savoir si tous les lettres d'une colonne soient identiques ou non. Si elles le sont, alors la cellule doit prendre la "valeur" des cellules de la même colonne (qui sont identiques) et si c'est non (au moins une cellule de la colonne n'est pas "égale" aux autres, la cellule doit prendre la valeur "N".

Je sais pas si j'ai été clair alors voici un exemple pour 2 lignes
A1=A; A2=T; A3=C
B1=A; B2=T; B3=G
=SI(A1=A2;A1;"N")
Le problème de cette fonction est que je n'arrive à la faire fonctionner que sur 2 lignes. Je voudrai pouvoir l'appliquer sur 200-300 lignes.
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[invitecb86aa79]

Bonsoir,

Il y a du gros boulot, du fait de la grosseur de tes données. Une macro serait plus idoïne.

[Great.J]

Grosso modo, Si les valeurs d'une même colonne sont identiques, alors la cellule prend comme valeur la valeur de la colonne("A1" par exemple, et si les valeurs des cellules d'une colonnes ne sont pas identiques, la cellule prend comme valeur "N"

[Great.J]

Le truc, c'est que j'y arrive mais avec deux formules (et j'en voudrai qu'une seule):
- la première :NB.SI(A1:A2;A1)
- la seconde : SI(A4=2;A1;"N")
Dans cet exemple, j'ai deux lignes

[A voir en vidéo sur Futura]

[invitecb86aa79]

Tu ne peux comparer deux cellules que dans une troisième cellule.

Tu dis "Si les valeurs d'une même colonne sont identiques" et tu compares dans une ligne : =SI(A1=A2;A1;"N")

Où est la cellule dans laquelle tu écris le résultat de ta comparaison ?

Tu peux écrire la formule de comparaison dans une autre feuille.

[Great.J]

J'écris la fonction dans la cellule A3.
Les colonnes portent comme tag des lettres et les lignes de chiffres ...
je ne comprend pas ce que ça ajouterai de l'écrire dans une autre feuille ...

[Great.J]

Voici ce que ça donne
en bleu : cellules où il y a formule
rouge : différence entre les 3 lignes

[invitecb86aa79]

"Dans la ligne 1 figure des lettres (A, T, G ou C), entre 500 et 5 000 lettres, de façon à ce que chacune d'elles soit dans une cellule différente" ?????
"Les colonnes portent comme tag des lettres et les lignes de chiffres ..." une colonne porte "les lignes des chiffres" ????????????

Si tu n'es pas plus précis et plus clair, je ne pourrais pas t'aider.

Tu t"es trompé dans l'énoncé. Tes données sont en colonne et tu compares dans la troisième colonne ?

L'utilisation d'une autre feuille permet de séparer la comparaison des données d'entrée, c'est utile lorsque tu compares beaucoup de données. Mais pour le début , tu peux rester dans la même feuille tout en séparant nettement les données d'entrés et le résultat de la comparaison..

Peux-tu communiquer une image de ton fichier avec une formule en texte, sans le signe = devant ?

[Great.J]

Pour les calculs, il faut commencer par la dernière ligne et remonter ensuite:
- Dans les cellules D1 à D3, combien de fois retrouve t-on la cellule D1 ?
- Si le nombre de cellules identiques dans une colonne est égale au nombre de lignes (ici 3), alors afficher D1, sinon, afficher "N"
Dans cette image, on ne voit que 6 lettres au lieu des 500 - 5000 histoire de simplifier

C plus clair ?

[invitecb86aa79]

Bon courage.

[Great.J]

Ah ah ! Tu abandonne ? ^^

[Flyingbike]

En gros si une seule ligne est différente la séquence consensus ne sortira pas ?!?

Pourquoi ne pas utiliser des outils déjà existants ??

[RomVi]

Bonjour

Je ne vois pas où est la difficulté, ou alors je n'ai pas compris...
Si tu arrive à le faire en 2 formules il suffit de les imbriquer, et tu n'en aura plus qu'une seule.

[choom]

Bonjour.
Et il t'est interdit de combiner tes 2 formules dans une seule ?
Comme: SI(NB.SI(D1: D3;D1)=3; D1; "N")

[invite948b37db]

Je voudra arriver à mettre une fonction, si c'est possible, qui permet de savoir si tous les lettres d'une colonne soient identiques ou non. Si elles le sont, alors la cellule doit prendre la "valeur" des cellules de la même colonne (qui sont identiques) et si c'est non (au moins une cellule de la colonne n'est pas "égale" aux autres, la cellule doit prendre la valeur "N".

A condition que le tableau soit réellement organisé comme tu le dis (*), et que tu aies 100 lignes remplies de données, met cette formule en ligne 101 :

=SI(NB.SI(A1:A100;A1)=LIGNE()-1;A1;"N")

(*) Je n'ai pas vu les dernières versions d'Excel mais je doute qu'elles soient maintenant à plus de 500 colonnes ?
Quant à l'inversion des tags lignes et colonnes, c'est encore plus mystérieux pour moi. Quel intérêt cette inversion ?

[invite046e427d]

Bonjour,
Il y a peut-être un autre moyen mais cela va faire beaucoup de formules.
Sur une autre feuille, traiter les données en cascades avec la fonction si, en faisant apparaître du "0" pour vrai et du "1" pour faux :
ligne 2 : Si(A1=A2;0;1) de la feuille initiale
ligne 3 : Si(A2=A3;0:1)
etc...
Ensuite sommer les colonnes et pour toutes celles où la somme=0 ====> on est bon.
Cdt

PS : mais vu la qté de formules je ne sais pas si ça passe !

[Great.J]

Flyingbike : en biologie, on appelle séquence consensus, une séquence qui nous indique si les séquences à partir desquelles elle est formée sont identiques (ou similaires) ou pas. En gros, cette séquence consensus sera composé de 5 lettres : A, T, G et C lorsque qu'à une position donnée, les lettres des autres séquences son identiques, et N lorsqu'à une position données, les lettres des séquences ne le sont pas.
Pk ne pas utiliser des outils existant ? Parce qu'à ma connaissance ça n'existe pas ^^

RomVi et Choom : Je ne suis pas très doué en math, et en excel pas des masses non plus. Je savais que l'on pouvait combiner des formules mais ne l'ayant jamais fait, je ne sais pas comment ça fonctionne ... Mais si cela fonctionne, c'est super

Cherbe : Merci pour la formule, je vais la tester J'ai finalement fait le tableau avec mes formule. les séquences font un peu plus de 3 200 bases en longueur (donc 3 200 colonnes) et j'en ai pris 126 (donc 126 lignes) et c'est passé donc ...

Merci pour votre aide !!

[Flyingbike]

Flyingbike : en biologie, on appelle séquence consensus, une séquence qui nous indique si les séquences à partir desquelles elle est formée sont identiques (ou similaires) ou pas. En gros, cette séquence consensus sera composé de 5 lettres : A, T, G et C lorsque qu'à une position donnée, les lettres des autres séquences son identiques, et N lorsqu'à une position données, les lettres des séquences ne le sont pas.
Pk ne pas utiliser des outils existant ? Parce qu'à ma connaissance ça n'existe pas ^^

Merci pour l'explication, mais je suis biologiste, et si j'ai proposé cette solution, c'est qu'elle existe et que je l'ai déjà utilisée

par exemple, il y a "multalin" un outil de l'inra. http://multalin.toulouse.inra.fr/multalin/

d'autres solutions ici : https://www.biostars.org/p/77762/ (avec un bel exemple graphique en bas)

C'est relativement basique comme besoin (par opposition à spécifique), du coup c'est sur qu'il existe déjà plein de solutions, autant en profiter

[invite948b37db]

Bonjour,
Il y a peut-être un autre moyen mais cela va faire beaucoup de formules.
Sur une autre feuille, traiter les données en cascades avec la fonction si, en faisant apparaître du "0" pour vrai et du "1" pour faux :
ligne 2 : Si(A1=A2;0;1) de la feuille initiale
ligne 3 : Si(A2=A3;0:1)
etc...
Ensuite sommer les colonnes et pour toutes celles où la somme=0 ====> on est bon.

La fonction SOMPROD fait ça d'un seul coup !

[invite046e427d]

Salut Cherbe,

La fonction SOMPROD fait ça d'un seul coup !

Je retiens, merci !

[invite948b37db]

les séquences font un peu plus de 3 200 bases en longueur (donc 3 200 colonnes) et j'en ai pris 126 (donc 126 lignes) et c'est passé donc ...

Les données "de base" sont stockées dans un fichier avec un titre par colonne et je suppose ?
Si oui, montre-nous un extrait de ce fichier. On doit pouvoir le traiter d'un coup et avec quelques "instructions basiques" sous Firefox et le plugin SQLite.
Si il n'y a pas de titre aux colonnes, je renonce !