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Human brain Project est financé

  1. mh34

    Date d'inscription
    mars 2008
    Messages
    17 174

    Re : Human brain Project est financé

    Ah tiens, puisque tu fais remonter le fil, pour ceux que ça intéresse, il y a dans le PLS de Mars un article ( en français! ^^) de Henry Markram en personne, et je dois avouer qu'il est bien convaincant, ( et très clair) sauf sur ça ( pour moi, hein...) :
    "notre approche est de tenter de reproduire l'ensemble des règles qui sont à l’œuvre lors du développement embryonnaire du cerveau..."
    Là je suis désolée mais...j'ai un doute sur "l'ensemble". Va quand même leur manquer quelques éléments...Il le dit implicitement d'ailleurs un peu plus loin lorsqu'il parle des avantages de l'HBP sur la recherche "in vivo" des origines d'une maladie avec utilisation de souris transgéniques, en remarquant que la neutralisation de certains gènes dans les modèles animaux entraine la mort de l'embryon...
    Ceci dit, d'un point de vue "embryologiste" ça va être intéressant à suivre.
    Il commence quand?

    -----

    νοὗσοι δ'ἄνθρώποισιν φέρουσαι σιγῇ, ἔπει φωνὴν ἕξειλετο μητιστα Ζεύς
     


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  2. Jiav

    Date d'inscription
    juillet 2004
    Messages
    8 243

    Re : Human brain Project est financé

    Citation Envoyé par mh34 Voir le message
    il y a dans le PLS de Mars un article ( en français! ^^) de Henry Markram
    Dsl je ne peux pas commenter c'est derrière un paywall
    The opposite of a deep truth may well be another deep truth. Information is physical.
     

  3. Jiav

    Date d'inscription
    juillet 2004
    Messages
    8 243

    Re : Human brain Project est financé

    Un répertoire naissant pour ce qui se dit sur le BAM

    http://empiricalplanet.blogspot.ca/2...bam-links.html

    Dernière en date un papier dans Science pour clarifier ce que serait ce projet. Très décevant àmha. Les objectifs sont ramenés à un niveau tellement modeste que je ne vois pas en quoi cela mériterait un investissement de 3 milliards. Franchement cela sent l'improvisation à plein nez. Mon interprétation est qu'ils ont été surpris de la naissance du HBM (qui est tout sauf mal préparé), encore plus qu'Obama le mentionne dans son discours à la nation, et que depuis ils pataugent. Bref ils ont dix ans de retard, et cela parait.
    The opposite of a deep truth may well be another deep truth. Information is physical.
     

  4. mtheory

    Date d'inscription
    août 2004
    Localisation
    Clermont Ferrand
    Âge
    47
    Messages
    11 630

    Re : Human brain Project est financé

    Citation Envoyé par Jiav Voir le message
    Un répertoire naissant pour ce qui se dit sur le BAM

    http://empiricalplanet.blogspot.ca/2...bam-links.html

    Dernière en date un papier dans Science pour clarifier ce que serait ce projet. Très décevant àmha. Les objectifs sont ramenés à un niveau tellement modeste que je ne vois pas en quoi cela mériterait un investissement de 3 milliards. Franchement cela sent l'improvisation à plein nez. Mon interprétation est qu'ils ont été surpris de la naissance du HBM (qui est tout sauf mal préparé), encore plus qu'Obama le mentionne dans son discours à la nation, et que depuis ils pataugent. Bref ils ont dix ans de retard, et cela parait.
    Donc si on résume en caricaturant à peine, les suisses c'est le LHC, les exoplanètes (Mayor), le cerveau (Markram) et l'information quantique (Gisin). Qui veut déménager à Genève ?
    “I'm smart enough to know that I'm dumb.” Richard Feynman
     

  5. Jiav

    Date d'inscription
    juillet 2004
    Messages
    8 243

    Re : Human brain Project est financé

    Citation Envoyé par mtheory Voir le message
    Donc si on résume en caricaturant à peine, les suisses c'est le LHC, les exoplanètes (Mayor), le cerveau (Markram) et l'information quantique (Gisin). Qui veut déménager à Genève ?
    Belle collection effectivement. En plus j'ai une petite nostalgie des montagnes qui s'installe avec le grand age...
    The opposite of a deep truth may well be another deep truth. Information is physical.
     


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  6. carracas

    Date d'inscription
    janvier 2005
    Localisation
    Namur
    Âge
    36
    Messages
    712

    Re : Human brain Project est financé

    Citation Envoyé par Jiav Voir le message
    Belle collection effectivement. En plus j'ai une petite nostalgie des montagnes qui s'installe avec le grand age...
    Tu veux revoir les elfes une dernière fois ? ^^
     

  7. Jiav

    Date d'inscription
    juillet 2004
    Messages
    8 243

    Re : Human brain Project est financé

    Citation Envoyé par mh34 Voir le message
    Ah tiens, puisque tu fais remonter le fil, pour ceux que ça intéresse, il y a dans le PLS de Mars un article ( en français! ^^) de Henry Markram en personne, et je dois avouer qu'il est bien convaincant, ( et très clair)
    Oui j'ai lu finalement et c'est excellent.

    Citation Envoyé par mh34 Voir le message
    sauf sur ça ( pour moi, hein...) :
    "notre approche est de tenter de reproduire l'ensemble des règles qui sont à l’œuvre lors du développement embryonnaire du cerveau..."
    Là je suis désolée mais...j'ai un doute sur "l'ensemble". Va quand même leur manquer quelques éléments...
    Oui bien sur, il parle de "l'ensemble" des règles qui sont en moyenne communes aux mammifères. Cela n'inclut pas les rétroactions physiologiques du corps, les interactions physiologiques avec la mère, etc (ou plus exactement, ces mécanismes sont supposés être approchables comme des "effets moyens" en première approximation).

    Citation Envoyé par mh34 Voir le message
    Il le dit implicitement d'ailleurs un peu plus loin lorsqu'il parle des avantages de l'HBP sur la recherche "in vivo" des origines d'une maladie avec utilisation de souris transgéniques, en remarquant que la neutralisation de certains gènes dans les modèles animaux entraine la mort de l'embryon...
    En fait là je crois qu'il fait une allusion à la multiplicité des rôles des gènes. Par exemple si un gène nous intéresse parce qu'il s'exprime dans certains neurones, il peut être impossible d'avoir des souris transgéniques non pas à cause de ce rôle dans le cerveau, mais parce que le gène s'exprime aussi dans le foie par exemple, ce qui fait que les knock-out ne sont pas viables. Ce n'est pas une limite complètement indépassable (par exemple on peut faire du conditional gene knockout, ou rendre un gène silencieux sur demande), mais c'est certain que les expériences seraient bien plus simples et rapides si on pouvait les faire sur un modèle informatique (quitte à valider l'information ensuite par des techniques plus traditionnelles).

    Citation Envoyé par mh34 Voir le message
    Ceci dit, d'un point de vue "embryologiste" ça va être intéressant à suivre.
    Il commence quand?
    Fin 2013, selon l'article.

    Citation Envoyé par carracas Voir le message
    Tu veux revoir les elfes une dernière fois ? ^^
    Non les elfes c'est la mer. C'est juste qu'ils vont peut-être avoir dans les montagnes quelque chose avec lequel j'aimerais jouer un peu.
    The opposite of a deep truth may well be another deep truth. Information is physical.
     

  8. mh34

    Date d'inscription
    mars 2008
    Messages
    17 174

    Re : Human brain Project est financé

    Citation Envoyé par Jiav Voir le message


    En fait là je crois qu'il fait une allusion à la multiplicité des rôles des gènes.
    Bien sûr...et plus un gène s'exprime dans un grand nombre de tissus plus il est difficile à étudier, c'est évident. Mais s'il s'exprime dans autant de tissus différents ( comme le LRP2 par exemple http://www.ncbi.nlm.nih.gov/IEB/Rese...lrp2&submit=Go) c'est que son rôle est fondamental et que les mutations sur ce gène impactent un grand nombre de fonctions qui ont obligatoirement des interactions entre elles...et le résultat de la simulation ne pourra de fait pas en tenir compte, donc il sera partiellement faux.

    Je reconnais que j'ai beaucoup de mal avec la méthode qui consiste à étudier le fonctionnement d'un organe ( quel qu'il soit mais surtout le cerveau c'est vrai) indépendamment des autres.
    νοὗσοι δ'ἄνθρώποισιν φέρουσαι σιγῇ, ἔπει φωνὴν ἕξειλετο μητιστα Ζεύς
     

  9. toothpick-charlie

    Date d'inscription
    juillet 2012
    Messages
    2 678

    Re : Human brain Project est financé

    Citation Envoyé par Jiav Voir le message
    En fait là je crois qu'il fait une allusion à la multiplicité des rôles des gènes. Par exemple si un gène nous intéresse parce qu'il s'exprime dans certains neurones, il peut être impossible d'avoir des souris transgéniques non pas à cause de ce rôle dans le cerveau, mais parce que le gène s'exprime aussi dans le foie par exemple, ce qui fait que les knock-out ne sont pas viables. Ce n'est pas une limite complètement indépassable (par exemple on peut faire du conditional gene knockout, ou rendre un gène silencieux sur demande), mais c'est certain que les expériences seraient bien plus simples et rapides si on pouvait les faire sur un modèle informatique (quitte à valider l'information ensuite par des techniques plus traditionnelles).
    ça suppose un modèle "chimique" du cerveau, j'avais compris que c'était un modèle "logique" qui était envisagé. Je pense qu'on n'est pas près de modéliser toutes les interactions entre molécules dans une cellule, neurone ou pas.
     

  10. Jiav

    Date d'inscription
    juillet 2004
    Messages
    8 243

    Re : Human brain Project est financé

    Citation Envoyé par mh34 Voir le message
    Mais s'il s'exprime dans autant de tissus différents (..) les mutations sur ce gène impactent un grand nombre de fonctions qui ont obligatoirement des interactions entre elles...et le résultat de la simulation ne pourra de fait pas en tenir compte, donc il sera partiellement faux.
    Pas nécessairement, car l'expression dans un tissu n'est pas forcément sous le même contrôle que dans un autre tissu. Par exemple l'ATP est maintenant considéré comme un neuromodulateur au niveau des vésicules synaptiques et de la fente synaptique, mais cela ne veut pas dire que la régulation de l'ATP dans les autres organes que le cerveau (ou même dans le cerveau, dans des compartiments autres) a un impact sur l'ATP en tant que neuromodulateur.

    Citation Envoyé par mh34 Voir le message
    Je reconnais que j'ai beaucoup de mal avec la méthode qui consiste à étudier le fonctionnement d'un organe ( quel qu'il soit mais surtout le cerveau c'est vrai) indépendamment des autres.
    Je suis plus ou moins d'accord avec toi. Oui je crois qu'en bout de ligne il faudra comprendre les interactions inter-organes (et inter-individus!) pour avoir un portrait final du fonctionnement du cerveau. Mais non je n'ai aucun mal à croire qu'une approche cerveau isolé peut apporter beaucoup d'informations. Pour prendre une analogie, c'est comme de décrire la surface de la Terre. Ultimement il faut prendre en compte les interactions avec la Lune, la rotation, la dynamique des plaques, l'érosion, etc. Mais en première approximation "boule" est une excellente description.

    Citation Envoyé par toothpick-charlie Voir le message
    ça suppose un modèle "chimique" du cerveau, j'avais compris que c'était un modèle "logique" qui était envisagé. Je pense qu'on n'est pas près de modéliser toutes les interactions entre molécules dans une cellule, neurone ou pas.
    C'est un modèle électrique. Il n'est effectivement pas question de modéliser les interactions entre molécules, par contre il est question de faire varier les propriétés des récepteurs. Par exemple on peut décider que tel récepteur est absent, ce qui est équivalent à un knock-out, ou fonctionne différement, ce qui est équivalent à une intervention pharmacologique.

    //

    J'en profite pour signaler une vidéo absolument bluffante en optogénétique. L'objectif du BAM serait de permettre ce genre d'enregistrement chez des animaux actifs de plus en plus en plus gros (ici zebrafish).




    PS:sous forme de lien
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  11. mh34

    Date d'inscription
    mars 2008
    Messages
    17 174

    Re : Human brain Project est financé

    Oh le bel OGM!
    Plaisanterie mise à part c'est vrai que c'est assez génial comme résultat. Bon maintenant...décryptage? Le feu d'artifice en particulier, à 0.18, correspond à quoi? Tu le sais?
    Dernière modification par JPL ; 21/03/2013 à 12h45. Motif: à la demande de mh34
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  12. mh34

    Date d'inscription
    mars 2008
    Messages
    17 174

    Re : Human brain Project est financé

    Bon ça y est j'ai les explications ( un grand merci à ma source perso...), ; ils ont utilisé une sonde calcique ( la GCamp5) qu'ils ont fait exprimer par la totalité des neurones et ont mis en évidence les variations de concentration calcique des différents neurones, donc les activations neuronales sans séparer les activations somatiques, dendritiques et axonales. Le flash à 0.18 est soit une grosse onde d'activation naturelle soit une réponse à un flash lumineux ou un autre type de stimulation, ce doit être détaillé dans la publi ici ; http://www.nature.com/nmeth/journal/...meth.2434.html. ( pas encore lu).
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  13. Jiav

    Date d'inscription
    juillet 2004
    Messages
    8 243

    Re : Human brain Project est financé

    Réponse technique: c'est bien cela, un OGM immobilisé mais vivant, dont les neurones possèdent des marqueurs d'activité qui s'activent quand ils sont illuminés (autre trick: ils utilisent une souche albinos de manière à pouvoir illuminer à travers l'oeil). Le principe est que la quantité de lumière que ces marqueurs retournent est fonction de l'activité des neurones. Ensuite, il n'y a plus qu'à regarder. Le niveau de résolution spatial est déjà suffisant pour identifier individuellement la plupart (80% au minimum) des (100 000) neurones de ce petit cerveau. Le niveau de résolution temporel est un peu moins bon (5ms toutes les 30 ms) mais choisit pour couvrir l'ensemble du système nerveux (800 × 600 × 200 μm3) toutes les 1.3 secondes environ.

    Réponse non technique: uploading en vue!

    (à part deux trois détails tels que injecter des marqueurs équivalents chez un non ogm, multiplier le champ de vue par 1 million, implanter des fibres optiques, un peu d'optique adaptative pour corriger pour les mouvements, éventuellement améliorer la résolution spatiale et temporelle par 10, et bien sur développer des solutions informatiques capables d'analyser cette quantité de données)
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  14. Jiav

    Date d'inscription
    juillet 2004
    Messages
    8 243

    Re : Human brain Project est financé

    PS: plus de détail sur la technique ici: http://www.jneurosci.org/content/32/40/13819.long
    The opposite of a deep truth may well be another deep truth. Information is physical.
     

  15. mh34

    Date d'inscription
    mars 2008
    Messages
    17 174

    Re : Human brain Project est financé

    Citation Envoyé par Jiav Voir le message

    Réponse non technique: uploading en vue!

    (à part deux trois détails tels que injecter des marqueurs équivalents chez un non ogm, multiplier le champ de vue par 1 million, implanter des fibres optiques, un peu d'optique adaptative pour corriger pour les mouvements, éventuellement améliorer la résolution spatiale et temporelle par 10, et bien sur développer des solutions informatiques capables d'analyser cette quantité de données)
    ...et parmi tous ces "détails" ( que tu as soigneusement mis en tout petit, tricheur! ) tu en oublies un d'importance ; on ne sait pas à quoi correspondent ces signaux ; on sait juste mettre en évidence un certain type d'activation neuronale globale et/ou en réseau par le marquage calcique. Faudrait peut-être commencer par décoder tout ça non?
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