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position des ponts disulfures

  1. adele62

    Date d'inscription
    décembre 2005
    Localisation
    lille
    Âge
    30
    Messages
    85

    Arrow position des ponts disulfures

    Bonjour!

    Je suis en L1SV, j'ai un exercice à faire et je ne comprends pas.
    On nous dit qu'un composé de nature protéique traité par le ß mercaptoéthanol libère deux peptides ayant la séquence suivante:

    1NH2-Gln-Pro-Val-Glu-Ser-Cys-Ala-Cys-Leu-Gly-Cys-Met-Leu-COOH
    2 NH2-Asn-Glu-His-Ala-Cys-Pro-Ser-His-Leu-Ile-COOH

    Ensuite, on hydrolyse le peptide intact avec de l'élastase et on libère ces fragments:
    1 Gln, Pro, Val
    2 Glu, Ser
    3 Ala, 2 Cys, Leu, Met
    4 2Cys, Gly, Leu, Pro, Ser
    5 Ala, Asn, Glu, His
    6 His, Ile, Leu

    On sait que cette enzyme clive après l'alanine, le glycocolle, la sérine et la valine (sauf si la proline se situe juste après).
    On me demande quelle est la position des ponts dissulfures dans la protéine originale.

    -----

     


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  2. adele62

    Date d'inscription
    décembre 2005
    Localisation
    lille
    Âge
    30
    Messages
    85

    Arrow Re : position des ponts disulfures

    Je sais que le ß mercaptoéthanol coupe les ponts dissulfures.
    Donc si l aprotèine était linéaire à la base il y aurait un pont dissulfure entre la leucine et l'asparagine, ce qui n'est pas possible puisqu'ils ne possédent pas de fonction thiol.
    Ca voudrait dire qu'il existe des liaisons intracaténaires et intercaténaires.
    Peut être entre la Cys (position 7 du premier fragemnt) et une autre (en position 8 du premier fragment).
    Mais ça n'explique pas pourquoi l'enzyme n'a pas coupé après l'alanine qui se situe entre les 2 cystéines.
    Bref, je ne vois pas coment on peut retrouver la position des ponts dissulfures.
    Quelqu'un a une idée ou une piste à me donner?
    Je vous remercie pour votre aide.
     

  3. Phoxinus

    Date d'inscription
    avril 2007
    Localisation
    Ariège
    Âge
    30
    Messages
    24

    Re : position des ponts disulfures

    Salut,
    tout d'abord un pont disulfure se trouve entre deux cystéines.
    Il faut donc que tu retrouve tous les fragments qui ne contiennent pas de cystéine entier dans les deux peptides traités au B-mercaptol. Par exemple, les 3 premiers résidus du peptide 1 correspondent au fragment 1.
    Ensuite, ce qui reste correspondra aux fragments 3 et 4 (qui contiennent de la cystéines) et il te restera à trouver les deux ponts disulfures (2Cys) qui permettent de retrouver les fragments 3 et 4.
    Ne prenez pas la vie au sérieux, de toute façon, vous n’en sortirez pas vivant_B.F
     

  4. acimabio

    Date d'inscription
    octobre 2007
    Localisation
    Casablanca
    Âge
    29
    Messages
    1

    Re : position des ponts disulfures

    Citation Envoyé par adele62 Voir le message
    Bonjour!

    Je suis en L1SV, j'ai un exercice à faire et je ne comprends pas.
    On nous dit qu'un composé de nature protéique traité par le ß mercaptoéthanol libère deux peptides ayant la séquence suivante:

    1NH2-Gln-Pro-Val-Glu-Ser-Cys-Ala-Cys-Leu-Gly-Cys-Met-Leu-COOH
    2 NH2-Asn-Glu-His-Ala-Cys-Pro-Ser-His-Leu-Ile-COOH

    Ensuite, on hydrolyse le peptide intact avec de l'élastase et on libère ces fragments:
    1 Gln, Pro, Val
    2 Glu, Ser
    3 Ala, 2 Cys, Leu, Met
    4 2Cys, Gly, Leu, Pro, Ser
    5 Ala, Asn, Glu, His
    6 His, Ile, Leu

    On sait que cette enzyme clive après l'alanine, le glycocolle, la sérine et la valine (sauf si la proline se situe juste après).
    On me demande quelle est la position des ponts dissulfures dans la protéine originale.
    salut Adele62!!
    En premier lieu il faut que tu comptes le nombre de cys présents dans les 2 peptides ainsi tu sauras combien il y aura de ponts disulfures. Dans cet exemple il y a 4cys donc on aura 2 ponts disulfures . En second lieu et afin de rendre la tache plus facile , numérote le 1er peptide de 1 à 13 ensuite numérote le 2ème peptide de 1 à 10 après tu commences à repérer les fragements d'acides aminés résultant de l'hydrolyse dans les peptides 1 et 2 ainsi tu auras le résultat suivant : un pont disulfure intracatenaire dans le P1 entre la cys8 et la cys11 / un pont disulfure intercatenaire entre la cys5 du p1 et la cys5 du P2!! ce n'est pas si compliqué finalement il faut juste un peu de concentration!!
     


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