un gène est une portion d'ADN (c'est une portion qui peut être transcrite pour donner un ARN et le plus souvent qui donnera une protéine), porté donc par un chromosome (ce n'est pas abstrait, on peut aussi le manipuler^^).
N'est ce pas là un abus de langage que de dire qu'un gène est transcrit. Ne serait ce pas plutôt un allèle qui est transcrit, manipulé concrètement ?

Je comprend bien ce que tu essais d'expliquer mais j'essaie de me mettre à la place de quelqu'un qui découvre ces notions et je pense que l'expression un "gène est manipulé" peut maintenir la confusion gène/allèle.