MCF7 cellules cancéreuses, 3 bandes ARN?
Bonjour à tous!
je travailles sur des cellules MCF7 de cancer mammaire humain donc eucaryote. après mon extraction d'ARN et migration sur gel j'observe 3 bandes or je n'attends que 2 bandes correspondant aux ARN r 18S et 28S.
ma 3ème bande est de taille plus faible.
les 3 bandes apparaissent clairement, il n'y a pas de smear.
à quoi correspond cette 3ème bande?
merci de votre réponse!
sarra
Salut!
Question bête...à quelle taille ets la troisième bande?? Est ce que ça peut correspondre (au milieu de la séquence) d'un des 2 rRNA?? Bon je ne pense pas mais on sait jamais, c'est tellement con
Vinc
quelle est la localisation de votre 3 ième bande?
la 3 ème bande est localisé lègèrement en dessous de ces 2 bandes qui sont trés proches l'une de l'autre.Envoyé par futurelight
je n'ai pas utilisé de marqueur de taille.
si vous voulez que je vous envoie la photo, ça sera sans pb!
merci de vos réponses!
oui, je voudrais bien voir la photo,
Oui moi aussi!
Vinc
voilà la photo!
là on voit la 3 ème bande mais sur d'autres gel elle est beaucoup plus marquée!
merci
Combien d'échantillons avez-vous utilisé ?
Ce n'est pas normal ?
si vous aviez mis que dans 2 puits ou carreaux , vous auriez dû avoir que 2 bandes.
????
J'ai pas tout comprit....
Vinc
c'est moi, qui n'ai pas bien compris, elle demande la bande qui est légèrement visualisée. J'ai compris la bande
1, 2 et la troisième,
enfin,,,, pardon
moi non plus!????
J'ai pas tout comprit....
Vinc
non ce que je ne comprend pas c'est la 3 ème bande obsérvé lors de mes dépots d'ARN extrait dans chacun de mes échantillons pour n'importe quel puit!
Oui ça moi par contre j'avais bien comprit
J'y réfléchis...
Vinc
je suppose que vos échantillons d'ARN ne sont pas purifiés,
j'ai eu présque les mêmes résultats, avec les échantillons non purifiés et puis j'ai fait une purification, et après la purification ces troisièmes bandes n'étaient plus visualisées sur le gel.
effectivement mes échantillons d'ARN sont extraits o trizol (phénol-isothiocyanate de guanidine)-chloroforme, précipités à l'isopropanol et lavé à l'éthanol. protocole classique!
ça voudrait qu'il ya une possibilité de présence de contamination?
Mouai... ou de dégradation! Parce que la contam est de faible taille seulement, donc c'est possible mais un peu surprenant... M'enfin pourquoi pas!
Vinc
mais généralement la dégradation est plus valable en présence de smear or ici c'est une bande trés nette!
si c'est une contamination ça serait pas quoi et tjrs à cette meme taille?
encore une question sans réponse!
ah oui c'est ça la science!
Salut,
Je dirais a vu de nez que cette bande est aux alentours de 100-150 pb et que c'est des tRNA...
A+
possible mais je ne pense pas qu'ils soient en % aussi élevé pour etre visible sur mon gel!
je ne sais pas!
à+
Salut
cette bande est au choix l'ARNr 5.8S ou les tRNA difficile a dire sans marqueur, mais vu la taille des deux autres rRNA je pencherai pour le 5.8S
En tout cas bravo ils sont beaux ces ARNs! Oublie la degradation c'est surement pas ca.
YOyo
bien merci pour toute vos réponse!
amicalement
sarra
Bonjour,
je ne sais pas si vous avez trouvé l'origine de la fameuse troisième bande ?
j'ai eu des surprises aussi avec les cellules MCF7, avec des analyses de facs
il semblerait qu' il y ai une sous population de cellules "au sein" de la lignée .
