Programme de bio-informatique
Répondre à la discussion
Affichage des résultats 1 à 10 sur 10

Programme de bio-informatique



  1. #1
    invite6709e8d6

    Programme de bio-informatique


    ------

    Bonjour

    Je cherche sur le net un programme bio-informatique qui regrouperais plusieurs programme d’analyse de séquences ADN et protéiques comme NIX anciens programme de HGMP qui pouvait traiter un contig
    connaissez vous un site hébergent ce type de programme
    Merci
    julie

    -----

  2. #2
    yoda1234

    Re : Programme de bio-informatique

    Message déplacé: Je pense que tu auras plus de chances de réponses dans ce forum.
    Là où l'ignorance est un bienfait, c'est de la folie d'être sage (Thomas Gray).

  3. #3
    invite7a8ce750

    Re : Portail sur la Bioinformatique

    Citation Envoyé par julie29 Voir le message
    Bonjour

    Je cherche sur le net un programme bio-informatique qui regrouperais plusieurs programme d’analyse de séquences ADN et protéiques comme NIX anciens programme de HGMP qui pouvait traiter un contig
    connaissez vous un site hébergent ce type de programme
    Merci
    julie
    Il existe des trucs payant qui font ça (ou équivalant).
    Sinon, il y en a peu de gratuits (à cause des BD qui ne sont pas dispo).
    Souvent en bioinfo, il faut apprendre à les développer soi même ^_^
    Bon tu peux quand même essayer
    « Software DNA »
    sur google, voir
    « software dna sequence analysis »
    tu en trouveras une coupe.

  4. #4
    invitea91ee15c

    Re : Portail sur la Bioinformatique

    Bonjour,


    Citation Envoyé par julie29 Voir le message
    Je cherche sur le net un programme bio-informatique qui regrouperais plusieurs programme d’analyse de séquences ADN et protéiques comme NIX anciens programme de HGMP qui pouvait traiter un contig
    connaissez vous un site hébergent ce type de programme
    Wisconsin Package, GCG, ... Ils sont peu nombreux mais jamais open source car autrement l'existance de sociétés bioinformatique ne serait plus possible et les postes de bioinformaticiens n'existeraient plus ou presque.

    Le meilleur dans ce domaine est à mon avis celui d'Accelrys.

    Cordialement,
    Desdemone
    bioinformaticienne

    PS pour le modérateur : c'est un sujet de biologie pas d'informatique, vous l'avez donc mal dirigé...

  5. A voir en vidéo sur Futura
  6. #5
    invite7a8ce750

    Re : Portail sur la Bioinformatique

    Citation Envoyé par desdemone Voir le message
    Bonjour,

    Wisconsin Package, GCG, ... Ils sont peu nombreux mais jamais open source car autrement l'existance de sociétés bioinformatique ne serait plus possible et les postes de bioinformaticiens n'existeraient plus ou presque.

    Le meilleur dans ce domaine est à mon avis celui d'Accelrys.

    Cordialement,
    Desdemone
    bioinformaticienne

    PS pour le modérateur : c'est un sujet de biologie pas d'informatique, vous l'avez donc mal dirigé...
    Les postes de bioinformaticiens pourraient très bien existé avec de l'open-source. Comme en IS, par exemple, ils pourraient servir de conseiller, de formateur, ils pourraient adapter des programmes existants, etc.

    Et la question porte sur un programme informatique donc est bien à sa place icite.

    G.
    Prof de bioinformaticien.

  7. #6
    yostral

    Re : Portail sur la Bioinformatique

    Ce n'est pas vraiment mon domaine, mais tu pourras peut-être trouver de l'aide sur BioloGeek.

    Peut-être aussi sur ce fil de Framasoft.

    Sinon quelques liens glanés ici ou là (je ne sais s'ils correspondent à tes attentes):
    e-PCR
    primer3
    sigma
    STRand
    Genographer
    divers...
    Quand tout le reste a échoué, lisez le mode d'emploi.

  8. #7
    JPL
    Responsable des forums

    Re : Programme de bio-informatique

    Pour multiplier tes chances d'avoir une réponse je déplace vers Biologie.
    Rien ne sert de penser, il faut réfléchir avant - Pierre Dac

  9. #8
    invite72953e70

    Re : Programme de bio-informatique

    Bonjour,
    Sans l'appui financier d'un gros labo, difficile d'avoir un ensemble de logiciel regroupé avec une interface "biologist friendly".
    Le mieux - je crois - est de fouiller un peu sur la page software de TIGR par exemple :
    Code HTML:
    http://www.tigr.org/software/
    ou sur le site de l'EBI :
    Code HTML:
    http://www.ebi.ac.uk/Tools/
    Evidement c'est parfois des logiciels à installer en local, de preférence sur une machine UNIX..
    Mais si tu nous precise quelles informations tu souhaites obtenir sur tes séquences, on pourra peut-être te guider dans le choix des outils à utiliser

    Hope this help
    Etienne

    NB : moi aussi je trouve que la bioinfo, c'est bien ici

  10. #9
    gorben

    Re : Programme de bio-informatique

    Salut,

    Je te conseille Vector NTI d'invitrogen (c'est gratuit).
    Sinon tu peux aller fouiller ici http://www.cns.fr/

    A+

  11. #10
    invitedb7ba594

    Re : Programme de bio-informatique

    Citation Envoyé par gorben Voir le message
    Salut,

    Je te conseille Vector NTI d'invitrogen (c'est gratuit).
    Sinon tu peux aller fouiller ici http://www.cns.fr/

    A+
    c'est plus gratuit!

Discussions similaires

  1. Bio-informatique et Bac S SI
    Par invite0e3786ef dans le forum Orientation avant le BAC
    Réponses: 15
    Dernier message: 24/02/2008, 00h47
  2. Bio-Informatique
    Par invitecfb758d1 dans le forum Orientation après le BAC
    Réponses: 2
    Dernier message: 13/02/2007, 17h40
  3. Bio informatique
    Par invited9ee56d4 dans le forum Orientation après le BAC
    Réponses: 3
    Dernier message: 10/02/2007, 09h26
  4. Bio Informatique
    Par invite67a9b6e5 dans le forum Orientation après le BAC
    Réponses: 4
    Dernier message: 12/11/2005, 14h23
Découvrez nos comparatifs produits sur le sport et la santé : thermomètre médical, soins personnels...