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analyse des séquences




  1. #1
    mortabit

    analyse des séquences

    slt tt le monde,

    J ai analysés mes séquences avec le blast, j ai eu une souche avec un pourcentage d'homologie de 100% mais avec plusieurs éspèces, comment expliquer ça et qu on trancher à propos de la souche correspondante.

    Pour d 'autre, aprés avoir établi des corrections au niveua des séquences, le pourcentage d homologie n a pas dépassé 99% et aussi avec plusieurs espéces????

    Une aide svp

    merci d avance

    -----


  2. Publicité
  3. #2
    ThinSwing

    Re : analyse des séquences

    moi je dirai que ta sequence est une sequence qui doit correspondre a quelque chose d'essentiel pour tte espece puisque retrouvée sans modifications...

  4. #3
    ThinSwing

    Re : analyse des séquences

    en general une sequence est modulée selon les especes a certains pourcentages : on parle d'homologues .


  5. #4
    Yoyo

    Re : analyse des séquences

    salut

    c'est quoi ta sequence? de l'ADNr?
    sinon ca depend evidemment de la distance evolutive entre les especes sur lesquelles tu as fait un blast

    yoyo

  6. #5
    Lord M

    Re : analyse des séquences

    Salut !

    Il semblerait que tu ais séquencé un gène dont l'intégrité est nécessaire à la survie d'un grand nombre d'espèces différentes : si la moindre mutation est délétère, ce gène se retrouve de facon identique chez plusieurs espèces.

    Si ce n'est pas indiscret, de quel gène s'agit t'il ? En général quand on fait de l'identification par cette méthode, on utilise le gène de l'ARN 16S, qui certe n'a pas un taux de mutation très élevé, mais on compense en en séquencant l'intégralité (1500 pb).
    Lord M

    What we do in life echoes in eternity

  7. A voir en vidéo sur Futura
  8. #6
    mortabit

    Re : analyse des séquences

    oui c est de l ADNr 16S, et j ai séquencé 1500pb

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