diamètre hélice alpha

[le_programmeur_en_bio]

bonjour,

j'aurais aimé connaitre le diamètre intérieur d'une hélice alpha

wiki anglais donne 1.2 nm de diamètre
un autre source parle de 2.3 A de rayon
mais ces valeurs ne correspondent pas

quelqu'un connait la bonne valeur ?
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[DaoLoNg WoNg]

Salut.

Le collagène constitué de trois chaines fait 1.5 nm de diamètre, donc 1.2nm ça fait beaucoup. En supposant que l'une des deux mesures est vraie, alors ce serait plutôt l'autre .

A vérifier. Bonne continuation.

[le_programmeur_en_bio]

bon, je vien tomber sur un 5 A de diamètre, ce qui correpond assez bien avec le 2.3 A de rayon...

je vais faire un nouveau sujet "exactitude des valuers trouvées sur le net"...


plus sérieusement, quelqu'un connait la vraie valeur ?

[mat_87]

moi, perso, je penche plus pour 1,2 nm de diamètre. 2,3 A sa fait petit c'est la taille d'un atome. Et puis, on trouve des choses bizarre sur wiki, moi je cherchais la taille d'un acide aminé, et il me dit 100 picomètre (10-12 m), ca fait 1 A !!!

[A voir en vidéo sur Futura]

[DaoLoNg WoNg]

il me dit 100 picomètre (10-12 m), ca fait 1 A !!!

pour un résidu c'est que j'ai dans mes cours. pour le diamètre de la chaine semble ainsi vraissemblable.

Bonne continuation.

[DaoLoNg WoNg]

La différence provient sûrement que certains comptent les chaines latérales qui dépassent du cylindre formé par l'hélice. Elles agrandissent très considérablement la chaine , il suffit de regarder une modélisation pour s'en convaincre. Etant donné que ces chaines sont de longueurs variables c'est beaucoup plus approximatif de les considérer.

Lien de la modélisation Wiikipedia

[le_programmeur_en_bio]

effectivement, si on considère un cylindre englobant l'hélice y compris les résidu, on doit tenir compte de la longueur des chainent latérale qui peuvent dépasser les 6 A...

mais c'est justement, ce que je ne veux pas

donc a priori 2,3 A est le rayon intérieur (sans tenir compte des chaines latérale) alors que 12 A de diametre correspond à l'ensemble de l'hélice (en prenant une longueur de chaine latérale moyenne)


j'aurai bien aimé l'avis d'un spécialiste

[mat_87]

pour la taille d'un acide aminé c'est bien environ 1,5 A . je voyai ca plus grand, mais en fait l'atome de carbone par exemple ne fait que 70 pm de diamètre.

[papeyeku]

Le diamètre des héclies alpha est identique pour toutes les cellules ?

Je pensais que ca variait selon les protéines...

[le_programmeur_en_bio]

si si, ça varie... enfin non !

c'est le diamètre intérieur de l'hélice qui ne varie pas

si tu mesure les distance sur un fichier pdb,
tu vas trouver (environ) comme longueur de chaine latérale :
1.6 A pour l'alanine
5.6 A pour la lysine
donc suivant les acides aminées qui la composent, le diamètre totale varie tout le temps...

mais ça ne réponds toujours pas à ma question