Salut,
En fait ce que tu decris Igothight est le principe du silencing que nous avons evoque plus tot non?
POur repondre a coco, oui on est sur de ne pas se tromper car l'insertion d'un gene dans un chromosome de levure se fait de maniere tres efficace et tres specifique. Comme en plus on connait tout le genome de la levure il est facile de verifier ou l'on a insere le gene en question
Ah la levure quel magnifique organisme
Yoyo
Attends, attends... je vois une différence avec le silencing...
Yoyo, tu m'as dis qu'il s'agissait de chromatine condensée, compaction qui réprimait les gènes situés au niveau de l'ADN pelotonné autour des histones.
Dans ce qu'écrit Igothigh (Bouh ces noms compliqués) il s'agit d'un compartiment du noyau où les gènes sont réprimés... enfin c'est ce que j'ai compris ...
Alors est-ce que la chromatine condensée est dans un compartiment, une région précise du noyau, et n'en bouge pas ???? Est-ce idiot comme question???ops:
Et comment sait-on qu'on insère un gène dans une région condensée ou décondensée du chromosome de levure... Et d'abord comment insérer un gène dans une "pelote" d'ADN condensée???
Oui c'est un bon resumeEnvoyé par coco
Et pourquoi les genes presents sur ce fragments d'ADN sont ils reprimes heinDans ce qu'écrit Igothigh (Bouh ces noms compliqués
Mais non c'est pas idiot (cf ma reponse ci-dessus), elle n'en bougerait pas temps qu'elle est inactive...Alors est-ce que la chromatine condensée est dans un compartiment, une région précise du noyau, et n'en bouge pas ???? Est-ce idiot comme question???
Je suis pas sur mais je crois que seule une analyse detaillee de la strucutre des chromosome peut nous permettre de determiner l'etat de condensement de la chromatine....Tu n'as pas de moyen a priori de le savoir, a part peut etre que les telomeres et autre centromeres sont des regions denses.Et comment sait-on qu'on insère un gène dans une région condensée ou décondensée du chromosome de levure...
Par recombinaison homologue (en tout cas chez le levure), il me semble cependant que ces regions condensees sont des points froids de recombinaison, c'est a dire que celle-ci est tres peu efficace. Mais a moins de connaitre differentes conditions dans lesquelles une meme region est alternativement condensee puis decondensee y'a pas bcp d'autre moyen.Et d'abord comment insérer un gène dans une "pelote" d'ADN condensée???
Yoyo
Bon, par recombinaison homologue... pour moi ça veut dire crossing over... tu sembles dire qu'on a du mal à insérer un gène dans de telle régions condensées, et Igothigh (bouh orthographe compliquée
Bon, là c'est trop complexe pour moi...
Merci pour toutes les infos....
Je detaille l'experience.
L'idee de depart est de montrer que effectivement dans le noyau il y a des zones ou les genes peuvent etre transcrit et d'autre nom et notament chez la levure que les telomeres qui sont situes en peripherie du noyau sont inactif non pas temps par leur nature mais plutot par leur position dans le noyau (chez les mammiferes, les centromeres sont en peripherie). D'apres les auteurs, il n'y avait que des suspicions mais pas de demonstration claire (il y a 2 ans de cela). Ils ont fait exprimer chez la levure une proteine transmembranaire recombinante ciblee dans le reticulum endoplasmique (qui est continue avec la membrane nucleaire) avec l'idee que cette proteine va a un moment passer dans le noyau et une partie de la proteine va faire face a l'interieur du noyau. Cette partie de la proteine est une proteine fusion avec Gal4 qui lie un certain nombre de promoteur de gene. En ce faisant, les genes sont deplaces de leur zone d'expression vers la peripherie et sont reprimes. Je ne suis plus sur, mais ce deplacement provoque aussi l'expression d'autre gene qui ne le sont pas normalement (par contrainte physique). Je viens de relire mes notes de meeting (pour une fois que ca sert
C'est sur que parfois on peut se poser des quesions... mais la biologie c'est parfois comme le bricolage, pas toujours d'equerre, mais ca tient quand meme
Effectivement, d'ou l'idee facinante je trouve que l"ADN doit se deplacer physiquement dans le noyau, et que l'absence d'expression peut se faire meme si les facteurs de transcription activateur se lient au promoteur. N'etant pas du tout du domaine, je suis probablement facilement "impressionable"mais les regiosn compactees des chromosomes ont une tendance a se regrouper dans des regions que l'on pourrait qualifier d'inactives... lors de l'activation par remodelage de la chromatine alors ces regions du chromosome "sortent" de cette zone d'inactivite pour se retrouver dans les zones de transcription actives. en tout ca sc'est comme ca que je vois les choses.
Ce qui me fait poser la question deja mentionner par Coco: qu'est ce qui genere ces contraintes physiques dans le noyau tout en sachant que l'espace libre y est probablement plus que restreint??
L'actine nucleaire y serait-elle pour quelque chose??
-"actine nucléaire"... ??? de l'actine comme dans un muscle???
-Les centromères à la périphérie... chez les mammifères... ???pourquoi??
-Y-at-il des gènes qui puissent s'exprimer au niveau du centromère???
-Les gènes situés à la périphérie seraient donc réprimés...???
Tant de questions...
Oui en fait dans le noyau il existerai au moins deux types de réseau.
i) un premier réseau constitué d'une proteine nommée lamine, qui joue un role dans la réplication de l'ADN ainsi que dans la transcription.
ii) UN deuxieme reseau constitué d'actine, et de protéines liées a l'actine. Celui-ci est impliqué dans le remodelage de la chromatine, le transport et la synthese des ARNm. (me demandez pas comment j'en sais rien
Je laisse igotigh repondre aux autres questions, je suis pas egoiste
Yoyo
Merci Yoyo, c'est trop aimable...Je laisse igotigh repondre aux autres questions, je suis pas egoiste
Yoyo
Excellente question et je n'en sais rien...
Je serais tenter de dire non mais je n'en suis pas sur. De plus, j'ai cru entendre que certaines sequences repetees de la region centromerique seraient transcrites et cliver en siRNA (RNA interferant)... Pourquoi? je n'en sais rien (je fais comme Yoyo, je prends les devantsY-at-il des gènes qui puissent s'exprimer au niveau du centromère???
Pourquoi pas mais rien n'est si sur...Les gènes situés à la périphérie seraient donc réprimés...???
Et pour l'actine, j'ai meme vu des experiences ou ils font polymeriser de l'actine dans le noyau... c'est joli mais je ne crois pas qu'on sache a quoi ca sert!!
Merci beaucoup à vous deux...
Alors là, il y a qqchose qui m'intéresse, c'est cette actine, qui donc est à l'origine de mouvements, et si on couple cette observation avec le fait que dans certaines zones du noyau, les gènes sont réprimés.... comme dans la jolie expérience décrite par Igothigh...
Mais de toute façon, si cette protéine intervient dans le remodelage de la chromatine, elle intervient dans la répression de gènes (silencing
Donc les transferts d'ADN d'un point à un autre, sa compactions, phénomènes physiques interviendraient dans la répression de gènes...
Alors pour les gènes homéotiques... ah oui, le problème c'est que l'intervention ordonnée de ces gènes dans l'espace et dans le temps, ne se fait pas dans la même cellule...Mais ces supposés phénomènes physiques expliqueraient que l'intervention d'un gène est lié à sa place sur le chromosome...
Bon, je m'amuse un peu, j'aime ça, mais vous pouvez effacer ce message qui n'apporte sans doute rien...
Voilà...
C'est drôle comme "un fil" (c'est ainsi qu'on dit?) se termine...
Que deviennent-ils quand ils sont vieux...
J'imagine toutes ces discussions arrêtées, mais qui ont laissé une trace...car ce sont des paroles écrites, des pensées captives...
Merci...
Salut coco,
Oui on appel bien ca un fil
Pour ce qui est des genes homeothiques il me semble que c'est un gradient (d'AMPc?) qui se cree selon l'axe d'expression. Ainsi en fonction de la concentration d'AMPc les cellules "savent" ou elles se trouvent dans l'embryons (qui n'est pas encore compartimenté, puisque la compartimentation depends justement des genes homoethiques).
Ceci dit j'ai trouve un autre exemple de regulation spatio temporelle; c'est le cycle cellulaire. et plus principalement les proteines nommees cyclines, sont etroitement regulee de maniere temporelle.
Yoyo
Alors là, quand tu auras un peu de temps, tu m'en diras davantage...
Que sont ces protéines?
Et en effet qu'est ce qui régule le cycle cellulaire... je pensais que c'était la concentrations en certaines molécules, protéines sans doute (les cyclines?), qui au delà d'un certain seuil étaient responsables de la division cellulaire... mais alors seul le temps entre en jeu...
Les cyclines sont des proteines, qui comme leur noms l'indique, cyclent durant le cycle cellulaire, elles peuvent etre stabilisées ou destabilisées par interaction avec d'autres proteines, ou par phosphorylation.
Voici un schéma pour te donner une idee de la regulation des cyclines lors du cycle cellulaire
<a href="http://virologie.free.fr/11-Cycle_cellulaire/images/regul_phospho.gif" target="_blank">
Cliquez ici pour agrandir l'image</a>
tu vois c'est tout simple
bon blague mise a part voici un graphe plus simple sur le taux de variation de certaines cyclines durant le cycle cellulaire.
Yoyo
oups j'ai oublié de recommander ces deux liens ou j'ai trouve justement les illustrations ci-dessus, et qui devraient expliquer plus clairement que moi le role exacte des cyclines dans le cycle cellulaire
Cycle cellulaire (pour les cyclines aller directement au chapitre 3.
Cyclines et CDK
Yoyo
