promoteur de la transcription

[invite64e85d2a]

Bonjour


j'ai une petite question (qui sera peut etre suivie d'une seconde selon la réponse ^^) sur les promoteur (TATAAT, TTGACA,....) de l'ADN :

Sont ils situés sur les brins codant ou sur le brins matrice transcrit de l'ADN ?
-----

[invitee863e61a]

Bonjour


j'ai une petite question (qui sera peut etre suivie d'une seconde selon la réponse ^^) sur les promoteur (TATAAT, TTGACA,....) de l'ADN :

Sont ils situés sur les brins codant ou sur le brins matrice transcrit de l'ADN ?

Le promoteur est situé sur le brin transcrit de l'ADN.

[invite64e85d2a]

Le promoteur est situé sur le brin transcrit de l'ADN.

mui, c'est bien ce qu'il me semblait, d'où ma vraie question :

pourquoi sont ils orienté de 5' à 3' (5' TATAAT 3') si ils sont sur le brin transcrit qui est lu de 3'P vers 5'OH ???

[invite160a5434]

J'avoue n'avoir jamais refléchi à ça et ce n'ets pas ininteressant.
A mon avis, et sachant que l'ajout des nucléotides se fait en 3' par la polymérase, les séquences énoncées promotrices sont les séquences codantes, comme la plupart des séquences données dans des textes. Aussi la fixation de la polymérase se fait sur le brin matrice, 3' -> 5'.

Mais ce n'est que mon avis, a verifier bien sur.

[A voir en vidéo sur Futura]

[invite64e85d2a]

es séquences énoncées promotrices sont les séquences codantes

tu veux parler des séquences du brin codant ou de séquences qui se retrouveraient codées sur le brin d'ARN ?


Perso je trouve bizarre l'idée de dire que les promoteur seraient décrit comme sur le brin codant étant donné qu'il est necessaire que les polymérases s'y fixent...

[invitee863e61a]

pourquoi sont ils orienté de 5' à 3' (5' TATAAT 3') si ils sont sur le brin transcrit qui est lu de 3'P vers 5'OH ?

La séquence TATAAT désigne une séquence type d'un promoteur telle qu'on la désigne en lisant le brin codant. Ce brin codant porte l'information d'initiation de transcription
Cette information est aussi portée sur son brin complémentaire: au cours de la transcription, l'ARN pol synthétise le brin complémentaire du brin matrice pour reconstituer un ARNm qui est la même séquence que le brin codant, et donc la même information.

D'autre part, attention, elle début sa synthèse à partir du (+1) de transcription! Le promoteur stricto sensu n'est pas transcrit.

[invitee863e61a]

tu veux parler des séquences du brin codant ou de séquences qui se retrouveraient codées sur le brin d'ARN ?


Perso je trouve bizarre l'idée de dire que les promoteur seraient décrit comme sur le brin codant étant donné qu'il est necessaire que les polymérases s'y fixent...

Les promoteurs sont des régions dont le but est de recruter des ARN pol. La capacité d'un promoteur à fixer des ARN pol est un facteur clé pour le niveau d'expression du gène qui suit.
D'ailleurs les séquences -35 (ex: TTGACA) et -10 (ex : TATAAT) de procaryotes comptent des bases qui entretiennent des contacts directs avec l'ARN pol!

[invitec9f0f895]

mui, c'est bien ce qu'il me semblait, d'où ma vraie question :

pourquoi sont ils orienté de 5' à 3' (5' TATAAT 3') si ils sont sur le brin transcrit qui est lu de 3'P vers 5'OH ???

parceque tu lis ta sequence promotrice dans le meme sens que ton gene. Mais ce n'est pas la séquence reconnue par l'ARN pol c'est la sequence antiparallele qui l'est (elle se fixe sur le brin transcrit, complémentaire du futur ARNm)

Yoyo

[invite49768933]

Bonjour à tous !!..

j' ai trouvé un intéréssant site . . sur la génétique ..en anglais . .

Learn.Genetic

Bonne navigation

[invite9a66960f]

Bonjour,

J'ai du mal à faire la distinction entre brin sens (ou codant) et brin antisens (opposé).

Dans mon cours il est dit que "lors de la transcription, information génétique portée par un brin est reccodé sur une chaine d'ARN en une séquence identique à celle d'un brin d'ADN que l'on appelle le brin sens (il va dans le même sens que l'ARN). La séquence d'ARN est aussi complémentaire et antiparallèle à la séquence du brin antisens utilisé comme matrice"

Ce n'est peut-être pas compliqué mais la différence entre les 2 brins restes confuse pour moi.

Et encore une question à propos du promoteur. Le promoteur est bien la région notée +1 ?
Et il est marqué "Les séquences d'ADN en amont du +1 (donc du promoteur) sont notés négativement et ne sont jamais retrouvé sur l'ARN".

Cela veut bien dire que les séquences qui se trouvent avant le promoteur ne sont pas transcrites du moins pas par cette ARN polymérase. Mais est-ce qu'il se peut qu'une autre ARN polymérase qui aurait commencé sa transcription ailleurs (beaucoup plus en amont) arrive jusqu'à ces séquences (celles notés négativement ici) et que donc elle les traduisent ? Est-ce que j'ai été assez clair ?

J'espère que vous pourrez m'aider et par avance je vous en remercie.

Bonne soirée

Nessa57

[invite9a66960f]

En continuant mes recherches sur la transcription voici ce que j'ai trouvé :

Brin trancrit = la matrice = brin non codant = brin antisens
Brin non transcrit = brin codant = brin sens

Tout d'abord est ce que vous pouvez me confirmer que ceci est exact ?
Et si c'est exact cela veut dire que l'ARN polymérase va se fixer sur le brin antisens = non codant pour former la molécule d'ARN.
Et le brin sens il sert à quoi alors ?

[invitee863e61a]

Bonjour,

J'ai du mal à faire la distinction entre brin sens (ou codant) et brin antisens (opposé).

Dans mon cours il est dit que "lors de la transcription, information génétique portée par un brin est reccodé sur une chaine d'ARN en une séquence identique à celle d'un brin d'ADN que l'on appelle le brin sens (il va dans le même sens que l'ARN). La séquence d'ARN est aussi complémentaire et antiparallèle à la séquence du brin antisens utilisé comme matrice"

Ce n'est peut-être pas compliqué mais la différence entre les 2 brins restes confuse pour moi.

Et encore une question à propos du promoteur. Le promoteur est bien la région notée +1 ?
Et il est marqué "Les séquences d'ADN en amont du +1 (donc du promoteur) sont notés négativement et ne sont jamais retrouvé sur l'ARN".

Cela veut bien dire que les séquences qui se trouvent avant le promoteur ne sont pas transcrites du moins pas par cette ARN polymérase. Mais est-ce qu'il se peut qu'une autre ARN polymérase qui aurait commencé sa transcription ailleurs (beaucoup plus en amont) arrive jusqu'à ces séquences (celles notés négativement ici) et que donc elle les traduisent ? Est-ce que j'ai été assez clair ?

J'espère que vous pourrez m'aider et par avance je vous en remercie.

Bonne soirée

Nessa57

Effectivement, le promoteur est la région nécessaire à l'initiation de la transcription: elle est située en amont du 1er nucléotide copié sur l'ARN (numéroté "+1"). Les nucléotides en amont sont numérotés négativement quand l'on se réfère au gène en question

[invite9a66960f]

euh merci mais ça je l'avait compris. C'est au sujet de la transcription de la séquence que j'ai un doute.

Ce qui est avant le promoteur n'est pas du tout transcrit par l'ARN pol qui se met sur ce promoteur ? C'est bien ça ?
Mais cette partie numéroté négativement peut quand même être transcite par une autre ARN pol avec un autre promoteur situé bien avant ?

Et pour les brins sens et antisens

[invitee863e61a]

euh merci mais ça je l'avait compris. C'est au sujet de la transcription de la séquence que j'ai un doute.

Ce qui est avant le promoteur n'est pas du tout transcrit par l'ARN pol qui se met sur ce promoteur ? C'est bien ça ?
Mais cette partie numéroté négativement peut quand même être transcite par une autre ARN pol avec un autre promoteur situé bien avant ?

Et pour les brins sens et antisens

La séquence numérotée négativement n'est pas transcrite par l'ARN pol qui transcrit le gène dont cette séquence est le promoteur en effet. Comme tu le dit, il peut y avoir un autre promoteur en amont qui fait que ces nucléotides sont transcrits mais cela correspond alors à une autre information.

Le brin sens = brin codant = brin sur lequel on lit le gène, la séquence codante et le promoteur
Le brin antisens = brin matrice = brin que l'ARN pol utilise comme modèle pour reconstituer la séquence (et donc l'info génétique) du brin codant.

[invite64e85d2a]

parceque tu lis ta sequence promotrice dans le meme sens que ton gene

mais justement le brin codant est lu de 3' vers 5' or la séquence promotrice est sur ce brin et est lu de 5' vers 3'

. Mais ce n'est pas la séquence reconnue par l'ARN pol c'est la sequence antiparallele qui l'est (elle se fixe sur le brin transcrit, complémentaire du futur ARNm)

Je comprend pas bien ce que tu veux dire ! si l'ADN pol reconnait la sequence complémentaire du promoteur, il ne reconnaitrait pas une sequence TATAAT mais une sequence ATATTA ! Ce qui n'a pas de sens, sinon pourquoi appeler la sequence TATA :!

La séquence TATAAT désigne une séquence type d'un promoteur telle qu'on la désigne en lisant le brin codant. Ce brin codant porte l'information d'initiation de transcription

Le brin sens = brin codant = brin sur lequel on lit le gène, la séquence codante et le promoteur

encore une fois, si elle est désignée ainsi en lisant le brin codant et que l'ADN pol se fixe sur l'ADN transcrit, ça n'a aucun sens (à mes yeux !)

PS : si quelqu'un pense avoir compris le principe, pourait-il fait un résumé clair,

[invitee863e61a]

On parle de TATAAT parce que c'est la séquence qui est dans le sens de l'information, à savoir de la séquence codante. Nous, ce qui nous intéresse, c'est de lire dans le sens qui nous place en amont de la séquence codante. Dans les publis, les séquences écrites en simple brin sont, par convention, dans le sens des séquences codantes, dans le sens codant, 5'-3'. Ainsi, on s'y retrouve plus facilement

[invite64e85d2a]

donc ça n'a aucun sens de dire que l'ADN pol reconnait la sequence TATA qui est sur le brin codant alors que l'ADN pol est sur le brin transcrit !

[piwi]

il ne reconnaitrait pas une sequence TATAAT mais une sequence ATATTA ! Ce qui n'a pas de sens, sinon pourquoi appeler la sequence TATA :!

TATA est une séquence consensus de toute façon. Il est rare de la trouver telle qu'elle au bon endroit sur le promoteur.

bye,
piwi

[invite32ebe868]

Attention, la séquence TATA est une séquence de promoteur comme déjà dit, dite consensus, cela veut dire que tous les promoteurs n'ont pas cette séquence exactement.
De plus, les promoteurs dit "à régulation positive" ont des séquences promotrices particulières qui font que ces promoteurs sont faibles et ont besoin de molécules (protéine de régulation) se fixant sur l'ADN (sur des sites appelé opérateurs) pour être fonctionnels.
Sinon, Brin codant-> donne séquence de l'ARNm en remplaçant les T par les U
Brin matrice-> brin lu par l'ARN pol. complémentaire à l'ARNm

Par convention, on note les séquences de 5'->3' d'où la fameuse TATA box.

[invite9a66960f]

Merci je crois que cette fois ci j'ai bien compris.

Bonne journée à vous

[invite64e85d2a]

ok ok, je pense qu'avec un peu de recul je vais enfin comprendre ces petits détails, mais avouons le, c'est un peu tordu quand même ^^

encore merci à tous

[invite18edf91e]

Merci pour votre question .
le promoteur sont séquence nucléotidique situé au niveau d'ADN dans le brin transcrit orienté 3' vers 5' .
En plus , le promoteur est le site de fixation de ARN polymerase pour démarrage la transcription a partir de premiere nucleotide
pour le promoteur chez les procaryotes moins 35 et moins 10 , par contre chez les eucaryotes moins 75 et moins 25