Bonjour a tous.
Je suis a la recherche d'un logiciel type Clustal pour realiser des alignements de sequences d'acides amines dans le but de tracer des arbres evolutifs. Malheureusement les sequences que je possede sont en txt et pas en FASTA ou autre.
Connaissez vous un programme complet qui me permette de tracer ces arbres en partant de fichier txt ou bien avez vous une idee de logiciel permettant la conversion des txt en FASTA ?
Merci bien.
Bonjour,
peut-être trouveras-tu ton bonheur ici : http://bioweb.pasteur.fr/seqanal/formats-fr.html
Dans le pire des cas, tu peux toi-même transformer tes séquences en Fasta, il suffit pour cela d'ajouter sur la première ligne le signe > suivi de ce que tu veux et ta séquences doit débuter sur la ligne suivante.
Par contre, je conçois que si tu as beaucoup de séquences cette solution ne sera surement pas la bonne
Bon courage !
Si tes séquences sont dans la GenBank, tu peux lui demander de l'afficher en format Fasta
Blast up your life!
salut
meme si tu as bcp de sequences, word te fait cela automatiquement
sans compter que je suis sur qu'il existe des programmes permettant de changer le format des sequences.
A savoir que PSI-BLast te constuit l'arbre phylo en fonction de tes alignements.
Yoyo
Merci de vos reponses.
N'ayant finalement qu'une quinzaine de sequences j'ai decide de transformer a la main
Merci bien.
