Répondre à la discussion
Affichage des résultats 1 à 6 sur 6

Epissage alternatif et codon start



  1. #1
    nicokupo

    Epissage alternatif et codon start

    Salut a tous

    Une question me trotte dans la tête : voila, prenons un gène formé de 11 exons et 10 introns. Ce gène subit un épissage alternatif dans lequel l’intron 1 est conservé. Dans l’intron 1, il y a un codon stop. Dans l’exon 4, on trouve un codon start (et évidemment un dans l’exon 1).
    Lors de la synthèse de protéine de ce variant d’épissage, est-ce que le ribosome fait la synthèse protéique de l’exon 1 (codon start) à l’intron 1 (codon stop) puis s’arrête. Ou bien peut-il reprendre la synthèse à partir du codon start de l’exon 4 pour produire une protéine tronquée ?

    chuss

    -----


  2. Publicité
  3. #2
    escherichia

    Re : épissage alternatif et codon start

    non ce n'est pas possible qu'il commence a l'exon 4, car les ribosomes se lie a une sequence specifique (shine-dalgarno chez les proc et kozack chez les eucaryotes) en amont du 1er ATG et non pas en amont de plusieurs ATG. donc il peut demarrer qu'a partir du 1er ATG.

  4. #3
    jmbowie

    Re : épissage alternatif et codon start

    Citation Envoyé par escherichia Voir le message
    non ce n'est pas possible qu'il commence a l'exon 4, car les ribosomes se lie a une sequence specifique (shine-dalgarno chez les proc et kozack chez les eucaryotes) en amont du 1er ATG et non pas en amont de plusieurs ATG. donc il peut demarrer qu'a partir du 1er ATG.
    Oui mais il a été décrit des cas ou le ribosome "saute" non?
    Blast up your life!

  5. #4
    Morphine

    Re : épissage alternatif et codon start

    Bonsoir,

    je pense que les IRES (internal ribosome entry site) peuvent se situer assez loin en aval du shine-dagarno.
    De même, il me semble que ce n'est pas toujours le 1er ATG qui correspond au +1. De mé moire, un prof m'avait dit qu'il existait une protéine dont la traduction commencait a partir du 12eme ATG.
    C'a doit être les "sauts" dont parle jmbowie.

    PAr contre, je ne pense pas que ces mcanismes impliquent de l'epissage alternatif.

  6. #5
    Yoyo

    Re : épissage alternatif et codon start

    Citation Envoyé par escherichia Voir le message
    non ce n'est pas possible qu'il commence a l'exon 4, car les ribosomes se lie a une sequence specifique (shine-dalgarno chez les proc et kozack chez les eucaryotes) en amont du 1er ATG et non pas en amont de plusieurs ATG. donc il peut demarrer qu'a partir du 1er ATG.
    C'est vrai chez les procaryotes mais pas chez les eucaryotes! Chez ces derniers la petite sous-unité du ribosome se lie a l'extremité 5' (la coiffe) puis scanne l'ARNm jusqu'a l'ATG, alors la grande sous-unité se fixe a la petite pour former le ribosome complet. La traduction démarre avec l'ARNt methionine dans le site P du ribosome.

    Citation Envoyé par nicokupo Voir le message
    Salut a tous

    Une question me trotte dans la tête : voila, prenons un gène formé de 11 exons et 10 introns. Ce gène subit un épissage alternatif dans lequel l’intron 1 est conservé. Dans l’intron 1, il y a un codon stop. Dans l’exon 4, on trouve un codon start (et évidemment un dans l’exon 1).
    Lors de la synthèse de protéine de ce variant d’épissage, est-ce que le ribosome fait la synthèse protéique de l’exon 1 (codon start) à l’intron 1 (codon stop) puis s’arrête. Ou bien peut-il reprendre la synthèse à partir du codon start de l’exon 4 pour produire une protéine tronquée ?

    chuss
    Non il ne le fera pas, mais pas pour les raisons indiquées. Dans le cas que tu donnes le codon stop est considéré comme "precoce", puisqu'il se trouve en 5' d'un jonction exon-exon. Dans ce cas la l'ARNm est dégradé par la voi "NMD" (non sense mediated decay), qui en plus inhibe la traduction.

    YOyo

  7. A voir en vidéo sur Futura
  8. #6
    piwi

    Re : épissage alternatif et codon start

    Mots clés pour une petite recherche sur internet:
    "leaky scanning" et IRES (internal ribosomic entry site)

    Cordialement,
    piwi
    Je sers la science et c'est ma joie.... Il parait.

  9. Publicité

Sur le même thème :

Discussions similaires

  1. [Biologie Moléculaire] Epissage alternatif
    Par Alegs dans le forum Biologie
    Réponses: 3
    Dernier message: 16/03/2008, 18h51
  2. [Biologie Moléculaire] Epissage alternatif
    Par riskeur dans le forum Biologie
    Réponses: 2
    Dernier message: 29/12/2007, 13h39
  3. Un 23ème codon???
    Par NOAH dans le forum Biologie
    Réponses: 32
    Dernier message: 06/12/2005, 10h30
  4. épissage alternatif et constitutif
    Par mag dans le forum Biologie
    Réponses: 1
    Dernier message: 20/04/2005, 13h38
  5. cadres de lecture et codon start
    Par Twilight dans le forum Biologie
    Réponses: 5
    Dernier message: 08/04/2005, 17h56