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Détermination de la taille d'un cDNA



  1. #1
    mamifrere

    Détermination de la taille d'un cDNA


    ------

    Bonjour,
    Pour un projet, je dois determiner la taille de plusieurs cDNA, sans passer par du séquençage.
    Je me vois mal faire un gel d'agarose même hyper résolutif sur des cDNA en faible concentration,ou le resultat de la taille ne serait pas trés précis.
    La taille approximative des mes ADNc serait entre 30 et 100 pb, ce qui m'interresse serait d'utiliser une technique ou un appareil ( assez courant ) afin de determiner la taille exact ( à la base prés si possible) sans forcement connaitre la sequence en nucléotides.
    En vous remerciant par avance pour vos précieux conseils.
    Je reste à l'écoute si vous avez besoin de plus amples information.
    a bientot
    mamifrere.

    -----

  2. #2
    Zellus

    Re : determination de la taille d'un cDNA

    Salut,

    Vu la taille de tes ADNc, tu peux utiliser un gel de polyacrylamide.

  3. #3
    MagikF

    Re : determination de la taille d'un cDNA

    Tu as aussi le 2100 Bioanalyser de chez Agilent ou l'Experion de BIO RAD qui sont des appereils qui font de l'electrophorése en µcapillaires hautement résolutif ; et en même temps ça quantifie...........

  4. #4
    mamifrere

    Re : determination de la taille d'un cDNA

    merci pour vos reponses.
    Tu as raison Magikf, nous disposons déja d'un bioanalyser 2100, néanmoins apres entretien avec le service Agilent France a propos de ma question initiale.
    Seul le kit Small RNA associé au logiciel 2100 expert pourrait enventuellement m'aider.Sauf que la rétention des cDNAs dans le gel de la "chip" Agilent, n'est pas super reproductible, ce qui sous entend ( d'apres Agilent ) qu'il est difficile d'estimer precisement ( à 1 ou 2 nucléotides pres ) , la taille d'un cDNA via le bioanalyser.

    Si vous avez d'autres remarques, merci d'ajouter vos commentaires.
    A bientot.

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