Bonjour,
Je travaille sur une souche de dermatophytes, actuellement je souhaite effectuer une PCR. Pour cela j'ai fouiné pas mal d'articles, j'ai trouvé des amorces qui correspondent à la région à amplifier (ITS1 et ITS2) malheureusement le blastage sur nbci (http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast...._LOC=blasthome) n'est pas satisfaisant.
Ma question est la suivante : Comment choisir les amorces ? Comment faire un blastage correct ?
Merci de votre aide.
Salut et bienvenu
Je pense que ça t'aidera mieux vu que c'est fait pour : http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/pr...last/index.cgi
Le problème est qu'il n'est pas certain qu'il soit possible d'utiliser primerblast pour l'oganisme considérer. Pour qu'il soit puissant il faut qu'il soit séquencé (correctement). L'est-il? Parce que si tu bastes contre une vague banque mal fichue, c'est pas trop la peine, autant acheter des oligos et tester soit même.
Cordialement,
piwi
Je sers la science et c'est ma joie.... Il parait.
