Salut,
J'ai un petit soucis de normalisation de signal sur une manip de ChIP-chip.
Lors de la manip, j'ai hybride sur l'array un ADN controle (cy5) et un ADN IP (Cy3). J'ai ensuite fais le ratio Cy3/Cy5 pour avoir le signal specifique de binding de ma proteine.
J'ai plusieurs conditions (no stress, stress10' stress30') et je voudrais maintenant les comparer 2 a deux. J'avais pense par exemple a faire :
"stress10" - "no stress", mais l'instensite du signal entre les deux manip est differente. Ma question est donc, comment normaliser mon signal? Est ce qu'il est correct de calculer la moyenne de mes signaux et d'appliquer un coef pour ramener cette moyenne a une valeur identique?
Merci
a+
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