Fragmentation ADN en end-point

[inviteffc39746]

Bonjour à tous,

J'aurais aimé savoir si quelqu'un aurait une définition de la fragmentation d'ADN en end-point.

Merci d'avance pour vos réponses
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[Edelweiss68]

Bonjour,

Quel est le contexte? Ca ne me dit rien, est-ce qu'il ne manquerait pas un mot? PCR en point final?

[inviteffc39746]

En fait je suis en train d'étudier un protocole Illumina de génotypage et comme toute grosse boîte il ne donne pas beaucoup d'info sur les réactifs à utiliser (nom bidon pour éviter de connaître ce qu'il mette dedans). Il s'agit d'amplifier l'ADN puis de le fragmenter et une phrase m'a interpellée : An end-point fragmentation is used to prevent over-fragmentation. (la phrase s'arrête là et donc je suis bien avancé!!!)
Sachant qu'il nous donne un réactif X à mettre avec l'ADN amplifier que je suppose être une solution d'enzymes de restriction avec peut-être autre chose dedans je n'en sais rien et qu'on doit incuber le tout pendant 1h.
En clair ce que je voulais savoir c'est qu'est-ce qui permet d'éviter la sur-fragmentation de l'ADN ?
J'espère que j'ai été clair dans mes explications et que ça va t'aider.

[Edelweiss68]

OK, pas trop d'infos là-dessus! Ils disent "End-point fragmentation is used to produce a consistent size of terminal fragments."(youhou!)

http://www.ohsu.edu/xd/research/rese...ead-arrays.cfm

Peut-être que cela signifie que la fragmentation par les enzymes est arrêtée à un point final dans le temps afin de limiter la sur-fragmentation...Je vois rien d'autre mais j'avoue que c'est intrigant!

[A voir en vidéo sur Futura]

[inviteffc39746]

merci d'avoir essayer de répondre à ma question. Je me disais que c'était peut-être la quantité d'enzymes qui était limitante au bout d'une heure d'incubation mais puisqu'on ne sait pas combien on en met dans la réaction on ne peut pas être sûr !!!