Petit point sur les interactions protéine-protéine

[invitebf669f42]

Bonjour,
Je sais qu'une protéine X interagit avec une autre protéine Y ... et en gros je dois caractériser cette interaction... du genre localisation du site d'interaction, détermination de la séquence protéique necessaire à cette interaction. j'ai bien pensé à des trucs du genre épitope mapping, construction de mutants et étude de l'interaction avec ces mutants... mé bon ca risque de prendre pas mal de tps... et du tps j en ai pas trop donc j'aimerais bien avoir un max de propositions si il y a plus simple pour pas trop cher tout en restant solide dans les resultats obtenus voila voila!! merci d'avance
-----

[inviteae6c05c4]

Bonjour,

Pour rapide et pas cher il y a les études in silico à partir des bases de données.

[gorben]

Salut,

Tu peux aussi faire du double hybride en faisant de la mutagenese aleatoire sur tes 2 proteines. Quand tu perds le double hybride c'est que tu as touche un site important pour l'interraction. Il ne te reste alors plus qu'a le sequencer et le caracteriser in vitro (meme pas obligatoire je dirais). C'est relativement solide et bien accepte comme methode.

A+

[TanguyE]

Je ne peux qu'approuver la méthode citée par Gorben par contre pour le "simple et pas cher"

Pour le in silico, c'est en effet pas cher mais ça comporte quelques limites (on ne peut en aucun cas prendre pour acquis ce qu'il se trouve dans les bases de données). Par contre ça peut te donner des idées.

[A voir en vidéo sur Futura]

[TanguyE]

Je ne sais pas si ça peut t'intéresser mais j'ai survolé ça dans une publi:

http://bond.unleashedinformatics.com/Action?

avec plus de détails ici:

http://en.wikipedia.org/wiki/Biomole...twork_Databank

Par contre je me suis pas vraiment attardé dessus donc à toi de voir...

[invite3bc8e732]

Sachez mon cher Artchifioul que rapide et pas cher en science ça n'existe pas !
Sincères salutations.

[invitec9f0f895]

salut

Je suis d'accord le double hybride est une bonne idée. Sinon la co-IP est pas mal aussi si tu as des anticorps ou que tes protéines sont taggées.

YOyo

[invite2e21fee6]

As-tu la chance d'avoir ces deux protéines purifiées ou non? Si non le double hybride est le plus facile, quoiqu'un peu simpliste (et pas forcément certains à 100%...), si tu as des protéines purifiées il existe pas mal de techniques intéressantes. Je t'en parlerai si tu le désire.