je voudrais comprendre le mécanisme de co-suppression chez les plantes. Un arn peut-il provoquer une co-suppression ou un RNAi sans être anti-sens à son "partenaire".
Merci
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24/09/2010, 15h45
#2
invite6a6b1a73
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Re : co-suppression/RNAi
Envoyé par ocho
Bonjour,
je voudrais comprendre le mécanisme de co-suppression chez les plantes. Un arn peut-il provoquer une co-suppression ou un RNAi sans être anti-sens à son "partenaire".
Merci
Personne ne peut m'aider?
25/09/2010, 20h52
#3
inviteae6c05c4
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Re : co-suppression/RNAi
En reformulant la question peut-être ?
26/09/2010, 09h24
#4
invite6a6b1a73
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Re : co-suppression/RNAi
Oui pardon
Au cours d'une étude sur la circulation des ARN dans le phloème, des chercheurs étudient des lignées transgéniques. Ils transforment des tomates soit avec le gène GAI (giberellic acide insensitive) de citrouille ou d'Arabidopsis.
NB: ils n'éteignent pas pour autant le gène GAI de la tomate
En applicant de l'acide giberellique sur des bourgeons, ils confirment que les lignées sont insensibles au GA. Jusque là, je comprends. Cependant, ils ajoutent que "Transgene expression can often result in RNAi or co-suppression of the endogenous gene and this silencing
event may be responsible for the observed phenotype."
Ce que je ne comprends pas car les gènes insérés dans le génome sont sens et je pensais que pour qu'il y ait RNAi ou co-suppression, il fallait l'arn sens qui se fait accrocher par un arn anti-sens.
Je ne suis pas sure d'avoir été plus claire
Aujourd'hui
A voir en vidéo sur Futura
26/09/2010, 18h28
#5
invite7aac4642
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Re : co-suppression/RNAi
Bonsoir
En ce moment j'étudie l'hybridation de l'ADN en bio mol et on a beaucoup de problèmes d'hybridation non-spécifique ou partielle.
Ce n'est donc qu'une idée en l'air mais serait-il possible qu'il existe un ARN anti-sens dont la séquence soit proche du gène étudié ? Etant donné que seules des conditions comme une forte concentration alcaline ou une forte température déstabilise suffisamment les hybridations non-spécifiques pour qu'elles n'aient pas lieu et que celles-ci ne se retrouvent pas in-situ, cette théorie est plausible non ?
Ginnie
26/09/2010, 21h26
#6
invite6a6b1a73
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Re : co-suppression/RNAi
Envoyé par Ginnie974
Bonsoir
En ce moment j'étudie l'hybridation de l'ADN en bio mol et on a beaucoup de problèmes d'hybridation non-spécifique ou partielle.
Ce n'est donc qu'une idée en l'air mais serait-il possible qu'il existe un ARN anti-sens dont la séquence soit proche du gène étudié ? Etant donné que seules des conditions comme une forte concentration alcaline ou une forte température déstabilise suffisamment les hybridations non-spécifiques pour qu'elles n'aient pas lieu et que celles-ci ne se retrouvent pas in-situ, cette théorie est plausible non ?
Ginnie
Hey! J'ai pas eu ma réponse
09/11/2010, 16h38
#7
invitec96b8390
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Re : co-suppression/RNAi
Bonjour ocho,
Je ne vais pas rentrer dans les détails mais, chez les plantes, un ARN sens peut tout à fait déclencher une réaction de RNA Silencing qui va cibler une séquence similaire (pas inversement complémentaire). Cela se produit notamment fréquemment avec les transcrits issus de transgènes qui sans que l'on sache précisément pourquoi sont reconnus par des ARN polymérases ARN Dépendantes qui vont produire un ARN double brin. Sans rentrer dans les détails cette ARN double brin peut potentiellement déclencher une reaction de RNA Silencing dirigée vers les transcrits complémentaires de l'un ou l'autre des deux brins qui le forme.
Tout cela est très simplifié mais les mécanismes du RNA Silencing sont complexes et variés, alors j'espère avoir répondu à ton interrogation.
@+++