Bonjour a tous,
J'aurai aimé savoir si vous connaissez un site ou une base de donnés qui reference une partie ou l'ensemble des structures des protéines (Enzymes, CoEnzymes, polypeptides, etc)
Par exemple : la structure de la NADH déshydrogenase.
Genbank?
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/
Mais ce site référence aussi selon l'espèce, donc à toi de voir laquelle tu veux ^^ pour l'homme, cherche en tant que Homo sapiens ;-D
Toutes les structures publiées sont référencées dans la Protein DataBank http://www.pdb.org/pdb/home/home.do
Sinon, tu es assez chanceux. La première structure RX de la NADH dehydrogenase (complex I) a apparemment été publiée cette année ! http://www.pdb.org/pdb/explore/explo...ructureId=3M9S
Autre chose, juste pour verifier :
Une protéine correspond à une séquence codante, on est bien d'accord !
Mais si, elle est présente dans 2 espèces totalement différentes, bien que l'on l'a nomme de la même façon, qu'elle assure le même role biochimique dans chacune des espèces et qu'elle agit de la même façon dans chacune des espèces : il y aura 2 séquences codantes au total pour la même protéine ?
(merci de vos reponses)
Oui il peut y avoir deux séquences codantes différente pour une même protéine identique à chaque acide aminé près.
Cela est du au fait qu'un même acide aminé est codé par différents triplets d'acides nucléiques (codons). Les différents codons ne sont pas utilisés préférentiellement de la même manière par les différents organismes.
Pour produire une protéine de plante en bactérie, j'ai du faire modifier et optimiser la séquence pour que les codons correspodent
Ouai cest bien ce que je pensais en me relisant...
Au passage, c'est pour des microorganismes pro et eucaryote (genre bacteries classique à levure)
Autre petite, mais asses poussé cette fois ci
Dans le cas des cytochromes : ce qui permet de les differencier est
1/ l'hème
2/ la fraction protéique (je rappele a cas ou que ce sont des hétéroprotéines)
Bref, pour differencier les cytochromes b, c et c1 qui dispose tous d'un (ou plusieurs dans le cas du b) hème ferrique, on se base sur la fraction protéique ? ou est ce qu'il y a des differences particulieres dans les liaisons propres de l'hème ?
