bonjour,
je veux savoir ce que c'est que les sous unité d'une chaine polypeptidique, est ce les acides aminées qui la compose? et aussi dans un resultat d'electrophorese comment reconnaitre le nombre de chaines polypeptidique ainsi que le nombre de sous unite
Les sous-unités représente la structure quaternaire de la protéine, c'est "l'assemblage" de plusieurs struture tertiaire (qui lui est le repliment des structure secondaire dans l'espace)
Dans une électrophorèse, c'est un peu compliqué, il faut être en condition dénaturante (avec du SDS par exemple) et utiliser du beta-mercaptoéthanol qui est un agent réducteur des ponts dissulfure. Cela va permettre de complètement dissocié la protéine. Cependant, selon ce que vous connaissez, il y a plusieurs démarches:
- Soit vous connaissez le poids moléculaire de votre protéine et vous pouviez en déduire le nombre de sous-unités (dans le cas des hétéromères)
- Soit vous ne saviez pas grand chose sur le fait que c'est un homo ou hétéromère (les sous-unités de même poids moléculaire se superpose au même Rf de migration) et vous deviez coupler cette expérience avec une chromatographie d'exclusion qui lui n'est pas en condition dénaturante et cela permet de connaitre la masse moléculaire totale de votre protéine où vous pourrez en déduire le nombre de sous-unité ;-D
Ce genre d'information est extrémement difficile à déterminer il faut combiner plusieurs approches pour avoir des informations complètes.
La spectrométrie de masse permettra de déterminer finement le nombre et l'agencement des séquences d'acides aminés mais c'est une action dénaturante donc pas moyen de déterminer la structure quaternaire (bien que certaines personnes pratiquent de la spectrométrie de "masse native".
La cristallographie reste le meilleur moyen de retrouver la structure fine de ta protéine mais la préparation d'échantillon est complexe et non garantie (extraction non dénaturante, cristallisation de la protéine, etc..)
La RMN offre les meilleurs informations sans avoir à manipuler les protéines mais plus la protéine est grosse plus le spectre est difficile à analyser et passé 30KDa, il faut faire appel à des spécialistes et ils sont rares...
Sinon il y a des méthodes via l'électrophorèse pour obtenir des informations mais il faut déjà savoir où on va...
merci de vos reponse, donc une sous unité c'est une chaine polypeptidique de la structure quaternaire?
Exactement ;-D
