[Biochimie] TP enzymologie
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TP enzymologie



  1. #1
    invitec5debdc4

    TP enzymologie


    ------

    Bonjour

    J'ai fais un tp d'enzymologie et j'ai du calculer la vitesse initiale grâce à la formule:
    Vi=(1/(epsilon*l))*(deltaA/deltat)
    La prof nous a rendu le tp et j'ai eu faut mais je ne comprends pas pourquoi. Voici mon calcul
    deltaA/deltat=(0,46-0,45)/(10-0)
    deltaA/deltat=0,001s^-1epsilon=1,8*10^-4L/mol/cm
    Vi=(1/(1,8*10^4*1))*0,001
    Vi=5,5*10^-8mol/L/s=55nmol/L/s
    Je ne comprends pas où est mon erreur mais je sais que j'aurais du trouver 0,55nmol/L/s.
    J'ai un autre TP que je dois rendre demain et j'ai le même calcul à faire avec d'autres chiffres et je voudrais pas me tromper.

    Est-ce-que quelqu'un aurait la gentillesse de me dire où est mon erreur?

    D'avance,
    merci

    -----

  2. #2
    Edelweiss68

    Re : TP enzymologie

    Bonsoir,

    D'où sort ta formule ? Quelles sont tes données ?

    Citation Envoyé par takata75 Voir le message
    deltaA/deltat=0,001s^-1epsilon=1,8*10^-4L/mol/cm

    Et ça, ça sort d'où ?

  3. #3
    invite75e918c6

    Re : TP enzymologie

    simplifions l'écriture car j'ai mal aux yeux

    delta = d

    donc dA/dt c'est la vitesse, donc à mon avis c'est par rapport à la tangeante sur sa courbe A = f(t)

    sinon d'après beer lambert

    A=E*l*c
    donc c= A/(E*l) et c/dt = dA/(E*l*dt)

    et je rejoins la fleur des montagne mais d'où sort tu dA/dt=0,001s^-1epsilon=1,8*10^-4L/mol/cm ??

  4. #4
    invitec5debdc4

    Re : TP enzymologie

    Bonjour,

    Ma formule pour calculer la vitesse initiale c'est la prof qui nous l'a donné.
    C'est par rapport à la loi de beer lambert A=epsilonlC
    où k est la pente dans mon exo k=deltaA/deltat
    et epsilon=deltaA/deltaC*l
    ici c'est pas deltaC mais deltat
    voila
    Le reste les chiffres c'est ce qu'on a calculer dans un tableau.

    epsilon=1,8*10^4^L/mol/cm
    voila est-ce plus claire pour m'expliquer?

  5. A voir en vidéo sur Futura
  6. #5
    invitec5debdc4

    Re : TP enzymologie

    En faite:


    Je pense que pour ce genre de formule alambiquée il est bon d'utiliser la mise en forme LaTeX. Toutes les informations sont ici: http://forums.futura-sciences.com/an...e-demploi.html

    A titre d'exemple j'ai corrigé la formule dans ce message.

    Pour la modération,
    piwi
    Dernière modification par piwi ; 05/11/2010 à 00h11.

  7. #6
    invite75e918c6

    Re : TP enzymologie

    Utilise delta = d, c'est plus claire pour les yeux ^^

    As-tu vérifié si tu n'avais pas de facteur de dilution (enfin le résultat aurait été pire) ou meme ne serait-ce une erreur de conversion des unités?

  8. #7
    invitec5debdc4

    Re : TP enzymologie

    J'ai tout vérifié et je ne vois pas du tout où est mon erreur.
    Je sais juste que la droite doit passer par l'origine et là elle ne passe pas par l'origine. Est-ce-qu'il ne faut pas mettre l=10^3 et non l=1cm?

  9. #8
    Edelweiss68

    Re : TP enzymologie

    Citation Envoyé par takata75 Voir le message
    Est-ce-qu'il ne faut pas mettre l=10^3 et non l=1cm?
    Ben non puisque ton ε est en L/mol/cm.

  10. #9
    invitec5debdc4

    Re : TP enzymologie

    Alors est ce que tu vois ou est mon erreur pourquoi je trouve pas Vi=0, ?

  11. #10
    Edelweiss68

    Re : TP enzymologie

    Le calcul final est juste mais c'est un peu le brouillon dans vos explications et je pense que l'erreur vient de ce manque de clarté. Relisez bien l'énoncé depuis le début, vérifiez vos données et regardez que cela colle au niveau des unités (métrologie).

  12. #11
    invite75e918c6

    Re : TP enzymologie

    Ta droite ne passe pas par l'origine?.... tu mesures quoi exactement, l'apparition ou la disparition du produit en fonction du temps?

    De plus, ce n'est pas un facteur 1000 mais un facteur 100 de différence... et bidouiller les cm pour les mettre en décamètre... bon c'est moyen ça ^^
    A moins que c'était en unité internationale ton epsilon où L s'exprime en metre et non en centimetre (1 cm = 10^-2 m)

  13. #12
    invitec5debdc4

    Re : TP enzymologie

    En fait dans mon tp j'ai préparé des dilutions de la solution enzymatique:
    Préparer dans des tubes à hémolyse 1mL de dilution de la solution mère e PAL à 10mg/L au 1/5,2/5,3/5,4/5,5/5 en tampon DEA pH=9,8.
    Conserver ces solutions dans la glace.

    Déterminatin de vi pour chaque dilution de la PAL:
    Les mesures de vi sont réalisées par cinétique en temps réel au spectrophotomètre à 405nm.
    Dans une cuvz de spectrophotomètr, introduire:
    1mL de solution de pNPP à 50mmol/L
    2,4 de tampon DEA à pH=9,8
    Vérifier que le spectro est réglé à 30°C en mode cinétique.
    Régler le zéro optique su spectro sur l'air.
    Pré-incuber la cuve de mesure 2 minutes à 30°C dans le porte cuve du spetro.
    Sortir la cuve pour déclencher la réaction par ajout de 0,1mL d'enzyme.
    Relever les valeurs toutes les 15s pendant 120 secondes.
    tableau:
    Dilution de la solutio,n mère 1/5
    rhopal de la solution fille (mg/L) 2
    volume de la solution mère de Pal(mL) 0,2
    volume de tampon DEA pH 9,8(mL) 0,80
    [PAL] dans le milieu réactionnel(mg/mL) 0,11

    temps(en s) 0 15 30 45 60 75 90 105 120
    Absorbance à 405nm
    Dilution 1/5 0,450 0,465 0,480 0,396 0,512 0,528 0,544 0,563 0,577

    Déterminer graphiquement dA/dt en s^-1
    Calculer Vi en nmol/L/s avec epsion=1,8*10^4L/mol/cm
    [PAL] dans le milieu réactionnel(mg/L) 0,11
    dA/dt(s^-1) 0,001
    Vi(nmol/L/s) 55,5
    C'est le 55,5 qui me choque parce que j'ai vu chez une camarade qui a eu une meilleur note que moi qu'elle trouvait 0, et je vois pas du tout où est mon erreur.
    Pouvez-vous m'aider en ayant tout l'énoncé?

    Merci

  14. #13
    invite75e918c6

    Re : TP enzymologie

    Qui te dis que le résultat Vi=O est bon? au moment où tu vois un changement d'absorbance, tu as une activité. Ne compare jamais les résultats expérimentale avec les autres, seulement leurs démarches

    Si ta droite ne passe pas par l'origine (c'est juste un détail) c'est parce que tu as fait le blanc avec l'air et non avec la solution sans l'enzyme

    Ensuite, je vois qu'il y a une dilution (il faut toujours en prendre en compte !)

    dA/dt tu l'as trouvé.... j'ai pas trop la tête à réfléchir ce soir (surtout que je sors d'une opération) et je ne vois pas trop le problème (ça m'a l'air correcte ce que tu avances,) je te conseille de sollicité ton/ta prof en lui montrant ta démarche ;-D

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