BONJOUR, jaurais besoin si possible d'une reponse dans les plus brefs delais...
Je voudrais savoir si le premier ATG que l'on trouve est forcement le debut de la traduction quand on est dans l'ADNc/l'ARNm?
Il me semble qu'il peut tres bien s'agir d'un autres atg de la 5' UTR mais on me soutient que non...
MERCI!!!
ATG ne veut pas dire codon d'initiation de la traduction. Il y a beaucoup d'ATG dans le génome et même dans un ADNc, ca n'est pas systématiquement le premier le bon. Il peut aussi y avoir plusieurs codons d'initiation fonctionnels dans un même cDNA.
MERCI javais vraiment peur de ne pas avoir compris mais j'avais donc raison...
Juste pour confirmation, je suis face a une sequence d'ADNc et une sequence proteique donc pour savoir parmi les ATG lequel est celui d'initiation de la traduction je regarde si les nucleotides apres le ATG ( sur sequence d'ADNc) codent pour l'Acide aminé suivant la Methionine de départ(sur sequzence proteique).
MERCI encore pour le temps que vous nous consacrez!
ben si tu as la séquzence de la protéine oui c'est simple, tu pars d'un ATG et tu regardes si ça colle...
Et si la séquence est trop grande, il me semble que tu peux utiliser ORF finder.
Si la séquence est grande, tu peux aussi utiliser ExPASy translate tool qui va te sortir tous les cadres de lectures. Les codons stop et les Met te sautent aux yeux et le bon cadre aussi du coup ^_^
Je sers la science et c'est ma joie.... Il parait.
C'est quoi l'avantage de expasy translate tool face à ORF finder ?
